More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0078 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 		 465 aa  963    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  42.52 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  42.64 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  42.64 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  41.47 
 
 		 461 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2609  glycosy hydrolase family protein  39.83 
 
 		 459 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2295  beta-glucosidase a  39.19 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  40.3 
 
 		 460 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  41 
 
 		 457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  41.06 
 
 		 462 aa  352  5.9999999999999994e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  39.57 
 
 		 460 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  39.57 
 
 		 460 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  39.57 
 
 		 460 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  39.35 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  38.92 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  39.83 
 
 		 461 aa  336  5.999999999999999e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0682  glycoside hydrolase family 1  40.3 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  38.33 
 
 		 459 aa  334  2e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  38.06 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  37.15 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1586  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  38 
 
 		 479 aa  320  3e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.816968  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1473  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  37.29 
 
 		 475 aa  309  6.999999999999999e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.27545  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0737  glycoside hydrolase family 1  39.05 
 
 		 478 aa  293  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  37.45 
 
 		 452 aa  291  1e-77  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3281  glycoside hydrolase family protein  37.8 
 
 		 475 aa  291  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0757  glycoside hydrolase family 1  37.53 
 
 		 478 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.778276  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  36.01 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3468  glycoside hydrolase family 1  36.93 
 
 		 478 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  32.99 
 
 		 475 aa  260  3e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  33.05 
 
 		 465 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  33.74 
 
 		 468 aa  247  4e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  32.71 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  33.47 
 
 		 470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  32.56 
 
 		 467 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  33.47 
 
 		 470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  31.21 
 
 		 471 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  32.46 
 
 		 451 aa  237  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  32.64 
 
 		 470 aa  237  4e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  31.59 
 
 		 438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  32.42 
 
 		 469 aa  236  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  33.04 
 
 		 439 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  32.03 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  32.17 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  32.53 
 
 		 444 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  30.04 
 
 		 469 aa  231  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  30.67 
 
 		 474 aa  229  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  32.77 
 
 		 487 aa  227  4e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  32.61 
 
 		 457 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  32.47 
 
 		 467 aa  226  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  32.25 
 
 		 462 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  31.55 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  31.05 
 
 		 452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  31.33 
 
 		 472 aa  223  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  32.47 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  30.72 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  31.24 
 
 		 489 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  31.53 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  31.66 
 
 		 458 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  30.48 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  32.16 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  31.14 
 
 		 470 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  31.07 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  31.73 
 
 		 459 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  31.57 
 
 		 479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  29.01 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  29.3 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  30.29 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  30.26 
 
 		 443 aa  210  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  31 
 
 		 468 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  30.25 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  30.84 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  30.52 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  32.03 
 
 		 470 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  30.28 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  32.75 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  30.24 
 
 		 463 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  29.58 
 
 		 440 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  29.96 
 
 		 476 aa  206  9e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  30.11 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  29.91 
 
 		 474 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  29.3 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  30.06 
 
 		 467 aa  204  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  30.29 
 
 		 500 aa  203  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  29.7 
 
 		 446 aa  203  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  29.63 
 
 		 443 aa  202  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  31.49 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  31.58 
 
 		 474 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  30.32 
 
 		 478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  29.09 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  29.81 
 
 		 452 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  31.42 
 
 		 485 aa  199  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  29.53 
 
 		 457 aa  199  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  30.84 
 
 		 471 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  30.04 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  31.52 
 
 		 475 aa  196  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  31.1 
 
 		 468 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  29.19 
 
 		 488 aa  196  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  30.59 
 
 		 457 aa  196  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  28.07 
 
 		 478 aa  196  7e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  30.54 
 
 		 465 aa  196  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>