40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0073 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0073  protein of unknown function DUF1304  100 
 
 		 126 aa  250  5.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3823  hypothetical protein  51.67 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.314285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2576  hypothetical protein  49.17 
 
 		 128 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1459  protein of unknown function DUF1304  48.62 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4598  protein of unknown function DUF1304  44.44 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1921  protein of unknown function DUF1304  42 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.980411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12650  predicted membrane protein  41.51 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.725167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0374  hypothetical protein  41.23 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2180  protein of unknown function DUF1304  36.21 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.299642  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0276  hypothetical protein  43.52 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75531  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0508  protein of unknown function DUF1304  41.44 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  45.45 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  38.46 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0443  hypothetical protein  33.08 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0455  hypothetical protein  33.08 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.720124  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2133  hypothetical protein  31.01 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1705  protein of unknown function DUF1304  42.55 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.449523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  41.38 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4116  protein of unknown function DUF1304  39.66 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532223  normal  0.15572 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4228  protein of unknown function DUF1304  39.66 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0648  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  36.21 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01662  hypothetical protein  39.34 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1160  hypothetical protein  35.4 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0975  hypothetical protein  35.4 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000480438  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05690  hypothetical protein  41.18 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04765  hypothetical protein  41.18 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1841  hypothetical protein  34.17 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3402  hypothetical protein  34.17 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1059  hypothetical protein  34.51 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2764  hypothetical protein  26.83 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000986388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1143  hypothetical protein  34.51 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0989  hypothetical protein  34.51 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1561  hypothetical protein  28.23 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  32.73 
 
 		 116 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1223  hypothetical protein  34.51 
 
 		 123 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1971  hypothetical protein  34.33 
 
 		 120 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000233421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0977  hypothetical protein  33.63 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1370  protein of unknown function DUF1304  38.1 
 
 		 120 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0191403  normal  0.202643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>