243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0070 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  60.24 
 
 		 186 aa  201  6e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  60 
 
 		 184 aa  194  6e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  46.99 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  49.46 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  49.08 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  49.45 
 
 		 181 aa  166  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  50.88 
 
 		 188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  43.96 
 
 		 183 aa  164  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  49.69 
 
 		 180 aa  164  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  45.11 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  47.46 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  45.56 
 
 		 189 aa  157  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  46.11 
 
 		 186 aa  156  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  44.02 
 
 		 201 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  46.39 
 
 		 182 aa  154  8e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  42.7 
 
 		 183 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  45.03 
 
 		 195 aa  151  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  42.62 
 
 		 184 aa  150  7e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  42.7 
 
 		 183 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  44.39 
 
 		 198 aa  150  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  45.61 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  43.48 
 
 		 192 aa  148  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  44.21 
 
 		 193 aa  147  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  47.44 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  46.45 
 
 		 189 aa  147  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  43.09 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  41.76 
 
 		 184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  46.51 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  45.06 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  46.75 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  43.17 
 
 		 184 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0916  LemA family protein  43.6 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.440516  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  41.97 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  43.71 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  45.4 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  42.08 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  44.02 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  44.97 
 
 		 249 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  38.97 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  47.16 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  45.4 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0912  LemA family protein  43.6 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  44.25 
 
 		 195 aa  141  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  42.22 
 
 		 199 aa  141  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0867  hypothetical protein  43.6 
 
 		 194 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  46.84 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  42.94 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0924  LemA family protein  45.61 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.278173 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  46.82 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  40.96 
 
 		 196 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  47.4 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  43.72 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  41.11 
 
 		 201 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  41.8 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  45.71 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  42.37 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  41.24 
 
 		 183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  41.11 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  41.15 
 
 		 194 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  39.58 
 
 		 197 aa  134  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  44.1 
 
 		 194 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  41.3 
 
 		 186 aa  134  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  46.91 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  45 
 
 		 208 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  45 
 
 		 208 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  38.97 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  40.68 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  40.68 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  47.48 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  42.78 
 
 		 196 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  44.83 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  40.44 
 
 		 182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  42.55 
 
 		 182 aa  130  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  45.99 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  43.48 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  46.01 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  44.1 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  42.68 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  46.67 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  44.25 
 
 		 208 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  42.19 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  42.39 
 
 		 201 aa  127  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0811  hypothetical protein  42.27 
 
 		 210 aa  127  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  42.05 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  46.67 
 
 		 187 aa  127  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  41.27 
 
 		 195 aa  127  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  48.67 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  38.74 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  42.33 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  40.12 
 
 		 187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  38.46 
 
 		 212 aa  125  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  37.17 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  42.2 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  44.83 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  39.38 
 
 		 197 aa  124  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  41.81 
 
 		 200 aa  124  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  41.21 
 
 		 196 aa  124  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  39.41 
 
 		 189 aa  124  8.000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>