More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0069 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0069  MgtE intracellular region  100 
 
 
625 aa  1263    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  54.91 
 
 
459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2041  MgtE intracellular region  37.75 
 
 
426 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1738  MgtE intracellular region  35.37 
 
 
430 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  37.9 
 
 
421 aa  253  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1158  MgtE intracellular region  34.89 
 
 
420 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3240  MgtE intracellular region  32.35 
 
 
433 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2656  Mg/Co/Ni transporter MgtE  36.41 
 
 
412 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0656  MgtE intracellular region  30.9 
 
 
417 aa  194  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000076098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1530  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 
423 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000568419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 
423 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  41.98 
 
 
462 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  41.98 
 
 
462 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  37.09 
 
 
486 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  34.53 
 
 
450 aa  177  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  36.24 
 
 
463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  31.04 
 
 
461 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  32.51 
 
 
466 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  35.2 
 
 
450 aa  170  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  35.27 
 
 
486 aa  169  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  34.66 
 
 
454 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  35.31 
 
 
452 aa  166  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  36.19 
 
 
458 aa  164  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  28.22 
 
 
451 aa  161  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  32.25 
 
 
442 aa  161  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  27.36 
 
 
425 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  36.82 
 
 
451 aa  160  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3817  MgtE intracellular region  32.3 
 
 
447 aa  160  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446632  normal  0.333957 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  36.3 
 
 
471 aa  160  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  34.83 
 
 
446 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  34.52 
 
 
454 aa  159  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1818  MgtE intracellular region  29.86 
 
 
429 aa  159  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.705628 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  31.14 
 
 
469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  35.81 
 
 
468 aa  157  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  38.08 
 
 
473 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  35.56 
 
 
469 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  35.93 
 
 
468 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  32.58 
 
 
449 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  32.51 
 
 
463 aa  155  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
446 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  35.56 
 
 
468 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  39.67 
 
 
454 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  35.83 
 
 
460 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0092  MgtE intracellular region  28.88 
 
 
425 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0286357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0122  MgtE intracellular region  30.33 
 
 
454 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  35.19 
 
 
468 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0901  MgtE intracellular region  31.14 
 
 
474 aa  150  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.885625  normal  0.115332 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  34.69 
 
 
469 aa  150  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  32.23 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  30.2 
 
 
465 aa  149  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7400  hypothetical protein  28.71 
 
 
430 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.090921  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1471  magnesium transporter  34.54 
 
 
449 aa  148  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  38.58 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  30.25 
 
 
461 aa  147  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  30.25 
 
 
461 aa  147  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2379  magnesium transporter  31.11 
 
 
473 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.573917  normal  0.465291 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  30.26 
 
 
445 aa  147  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  27.25 
 
 
484 aa  147  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  31.7 
 
 
449 aa  146  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0320  divalent cation transporter  33.72 
 
 
460 aa  146  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0139413 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  35.03 
 
 
444 aa  146  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  31.52 
 
 
450 aa  145  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3075  magnesium transporter  29.62 
 
 
473 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0843  magnesium transporter  28.64 
 
 
449 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3340  magnesium transporter  30.18 
 
 
473 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  27.05 
 
 
460 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1436  MgtE intracellular region  27.05 
 
 
425 aa  144  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000684076  decreased coverage  0.0000760195 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  27.93 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  34.6 
 
 
463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  27.04 
 
 
443 aa  141  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  34.57 
 
 
449 aa  141  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1890  magnesium transporter  30.92 
 
 
460 aa  141  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  30.42 
 
 
482 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1354  magnesium transporter  36.48 
 
 
456 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0828283  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1190  MgtE intracellular region  30 
 
 
445 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.067335  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1134  MgtE intracellular region  29.98 
 
 
412 aa  140  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121056  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  29.4 
 
 
451 aa  140  7.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  31.64 
 
 
445 aa  140  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl217  Mg/Co/Ni transporter  31.7 
 
 
468 aa  139  1e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  29.18 
 
 
470 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2058  magnesium transporter  32.95 
 
 
460 aa  139  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  28.32 
 
 
447 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  28.54 
 
 
480 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  30.26 
 
 
445 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2786  magnesium transporter  34.46 
 
 
463 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8408  MgtE intracellular region  30.02 
 
 
426 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  29.15 
 
 
473 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  28.93 
 
 
480 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  32.62 
 
 
449 aa  137  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1158  MgtE intracellular region  29.84 
 
 
435 aa  137  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  31.05 
 
 
454 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  28.93 
 
 
480 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  28.79 
 
 
444 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  27.68 
 
 
424 aa  137  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  30.42 
 
 
542 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  28.93 
 
 
480 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  29 
 
 
449 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  30.28 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01460  Mg2+ transporter MgtE  30.14 
 
 
452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2208  MgtE intracellular region  29.48 
 
 
432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>