More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0064 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  100 
 
 		 447 aa  891    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  54.59 
 
 		 446 aa  465  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  52.54 
 
 		 443 aa  423  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  35.65 
 
 		 444 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  38.17 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  36.5 
 
 		 431 aa  266  5.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  35.59 
 
 		 434 aa  264  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  35.75 
 
 		 465 aa  262  8e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  37.3 
 
 		 445 aa  256  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  36.6 
 
 		 441 aa  255  9e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  33.57 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  34.63 
 
 		 447 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  35.44 
 
 		 438 aa  249  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  34.32 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  35.58 
 
 		 479 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  34.84 
 
 		 434 aa  239  5.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  33.49 
 
 		 420 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1409  hemolysin-like protein  32.59 
 
 		 447 aa  239  9e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  34.58 
 
 		 533 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  35.77 
 
 		 555 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  34.03 
 
 		 432 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  34.79 
 
 		 436 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  32.44 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  36.47 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  31.75 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  36.5 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  32.87 
 
 		 434 aa  233  6e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  34.32 
 
 		 436 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  36.25 
 
 		 421 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0014  CBS domain protein  31.55 
 
 		 431 aa  231  3e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000513416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  35.81 
 
 		 444 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2040  hypothetical protein  33.49 
 
 		 418 aa  230  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0915  protein of unknown function DUF21  33.41 
 
 		 460 aa  226  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 		 470 aa  226  8e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  35.88 
 
 		 456 aa  226  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  32.62 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  33.79 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  31.44 
 
 		 437 aa  223  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  33.96 
 
 		 429 aa  223  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  33.42 
 
 		 445 aa  222  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  33.5 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  31.75 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  33.42 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  32.73 
 
 		 437 aa  220  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  31.4 
 
 		 434 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  32.58 
 
 		 433 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  30.5 
 
 		 436 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.52 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0947  hypothetical protein  32.78 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  31.22 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  31.22 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  31.22 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  31.15 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  29.58 
 
 		 447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  30.07 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  31.29 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  31.12 
 
 		 425 aa  217  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  29.64 
 
 		 440 aa  217  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  33.81 
 
 		 433 aa  217  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  31.08 
 
 		 442 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  31.76 
 
 		 438 aa  216  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  31.21 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  33.89 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  32.06 
 
 		 430 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2633  protein of unknown function DUF21  32.31 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  30.96 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  32.7 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  29.82 
 
 		 451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  31.55 
 
 		 443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  31.55 
 
 		 443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  29.41 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  32.24 
 
 		 424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2361  hypothetical protein  30.64 
 
 		 432 aa  213  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00115702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  30.51 
 
 		 442 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  30.62 
 
 		 443 aa  213  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  30.47 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  31.97 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  31.75 
 
 		 438 aa  211  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  31.03 
 
 		 458 aa  210  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  32.54 
 
 		 443 aa  210  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  32.61 
 
 		 429 aa  210  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  31.83 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  31.77 
 
 		 436 aa  210  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  30.66 
 
 		 445 aa  210  5e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  30.34 
 
 		 441 aa  210  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  31.76 
 
 		 424 aa  209  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  34.52 
 
 		 439 aa  209  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  39.09 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  31.31 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1399  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5899  hypothetical protein  32.61 
 
 		 430 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  32.85 
 
 		 430 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  31.44 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  34.05 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  31.9 
 
 		 446 aa  207  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4147  protein of unknown function DUF21  30.72 
 
 		 463 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  29.12 
 
 		 443 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  31.34 
 
 		 436 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  33.41 
 
 		 446 aa  207  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4107  protein of unknown function DUF21  30.72 
 
 		 463 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>