17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0058 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0058  hypothetical protein  100 
 
 
614 aa  1211    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2748  hypothetical protein  29.7 
 
 
529 aa  144  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4583  permease  26.65 
 
 
526 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0750795  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4673  hypothetical protein  26.09 
 
 
524 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0277  hypothetical protein  25.37 
 
 
524 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3007  hypothetical protein  23.78 
 
 
528 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00741341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0196  putative ABC transporter, permease protein  22.5 
 
 
532 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3340  hypothetical protein  21.32 
 
 
552 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3364  hypothetical protein  22.83 
 
 
552 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3361  hypothetical protein  22.83 
 
 
552 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3139  hypothetical protein  22.83 
 
 
552 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0126843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3386  hypothetical protein  22.83 
 
 
552 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.743067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3033  ABC transporter permease  22.83 
 
 
552 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000402188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3126  ABC transporter permease  22.83 
 
 
552 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15300  hypothetical protein  24.09 
 
 
534 aa  44.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.248358  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2039  hypothetical protein  22.59 
 
 
559 aa  44.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00195767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1890  hypothetical protein  22.05 
 
 
552 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>