45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0056 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0056  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  136  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2126  hypothetical protein  68.09 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.669451 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2422  hypothetical protein  43.75 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0386  hypothetical protein  53.19 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00058247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1105  hypothetical protein  54 
 
 		 59 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1262  hypothetical protein  49.06 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04454  hypothetical protein  52 
 
 		 59 aa  62  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2917  hypothetical protein  48 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.720765  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3487  hypothetical protein  52.83 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3455  hypothetical protein  48.94 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1210  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1901  hypothetical protein  53.19 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4354  hypothetical protein  55.1 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157382  normal  0.541932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3864  hypothetical protein  52.17 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.589576  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01582  hypothetical protein  54.76 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1923  hypothetical protein  51.02 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1881  hypothetical protein  46.15 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3656  hypothetical protein  47.92 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105429 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0344  hypothetical protein  46.81 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.764143  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0785  hypothetical protein  39.22 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0782  hypothetical protein  53.19 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1975  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2236  hypothetical protein  38.33 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113885 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1362  hypothetical protein  41.67 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.62908  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6392  hypothetical protein  49.02 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.109698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1299  hypothetical protein  48 
 
 		 55 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2873  hypothetical protein  47.73 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0329  hypothetical protein  47.5 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2249  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584224  normal  0.945826 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0287  hypothetical protein  47.5 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1438  hypothetical protein  47.92 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.254968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0300  hypothetical protein  47.5 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0346  hypothetical protein  47.5 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0105  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0281  hypothetical protein  47.5 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0373  hypothetical protein  47.5 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0332  hypothetical protein  47.5 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4974  hypothetical protein  47.5 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0281  hypothetical protein  47.5 
 
 		 52 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3447  hypothetical protein  47.92 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0210  hypothetical protein  40.43 
 
 		 64 aa  50.1  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2130  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0218  hypothetical protein  48.78 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2840  hypothetical protein  48.78 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0109856  normal  0.0353192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3196  hypothetical protein  54.76 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.848761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>