119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0055 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  100 
 
 		 328 aa  669    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  62.32 
 
 		 310 aa  349  3e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  51.52 
 
 		 303 aa  308  5.9999999999999995e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  49.39 
 
 		 291 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  55.83 
 
 		 289 aa  294  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  48.17 
 
 		 302 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  47.56 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  49.37 
 
 		 294 aa  282  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  53.49 
 
 		 287 aa  279  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  52.33 
 
 		 284 aa  275  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  50.74 
 
 		 282 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  50.18 
 
 		 293 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.09 
 
 		 281 aa  265  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.37 
 
 		 281 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  49.08 
 
 		 309 aa  262  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  46.59 
 
 		 293 aa  261  8.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  52.36 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  45.85 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  49.64 
 
 		 281 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  48.23 
 
 		 305 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  49.22 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  46.72 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  49.63 
 
 		 281 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  43.73 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  41.89 
 
 		 352 aa  252  7e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  41.85 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  45.79 
 
 		 281 aa  242  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  45.79 
 
 		 281 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.79 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.79 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.79 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  45.79 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  45.42 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  45.79 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  45.79 
 
 		 281 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  46.74 
 
 		 281 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  48.68 
 
 		 280 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  47.6 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  45.62 
 
 		 281 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  46.52 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  46.18 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  47.24 
 
 		 286 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  41.56 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  46.95 
 
 		 310 aa  228  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  41.61 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  44.33 
 
 		 295 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  37.09 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  37.09 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  36.2 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  38.58 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  36.25 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.84 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  39.41 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  55.15 
 
 		 132 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  27.75 
 
 		 498 aa  63.2  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  29.41 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  26.09 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  25.23 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  28.81 
 
 		 393 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.36 
 
 		 270 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  32.59 
 
 		 474 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  28.38 
 
 		 441 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  28.38 
 
 		 453 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  28.74 
 
 		 435 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  24.88 
 
 		 386 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  23.62 
 
 		 379 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  29.03 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  29.66 
 
 		 471 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1829  HflK protein  27.4 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51115  normal  0.182699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  25.12 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  22.22 
 
 		 395 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  27.4 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  27.4 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  28.4 
 
 		 464 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  28.93 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  22.27 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  25.26 
 
 		 399 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  23.71 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  23.71 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  24.47 
 
 		 437 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  24.47 
 
 		 442 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  27.01 
 
 		 399 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  24.47 
 
 		 437 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  24.47 
 
 		 437 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  24.47 
 
 		 454 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  23 
 
 		 361 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  24.47 
 
 		 449 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  24.47 
 
 		 454 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  26.84 
 
 		 465 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  25.21 
 
 		 258 aa  46.2  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2534  HflK protein  23.61 
 
 		 466 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0683686  hitchhiker  0.0000321559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1601  FtsH protease activity modulator HflK  23.24 
 
 		 460 aa  45.8  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.13244 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1161  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.27 
 
 		 248 aa  45.8  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  27.4 
 
 		 434 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  22.11 
 
 		 394 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  22.87 
 
 		 445 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  25 
 
 		 447 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  28.95 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  24.54 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  26.45 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>