95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0047 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0047  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 164 aa  342  1e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0901  hypothetical protein  68.87 
 
 		 151 aa  228  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000619328  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1138  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  59.59 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0263958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3382  histidine triad (HIT) protein  34.81 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3237  histidine triad (HIT) protein  30.41 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0530  HIT family protein  36.97 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.335836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2993  histidine triad (HIT) protein  42.7 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000103081  normal  0.516918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3912  histidine triad (HIT) protein  35.07 
 
 		 142 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000268802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3073  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  38.1 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000547688  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3617  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0338  histidine triad (HIT) protein  32.33 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02755e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0357  histidine triad (HIT) protein  29.14 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00612046  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0559  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase  33.33 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.344449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2366  hypothetical protein  32.79 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1028  histidine triad (HIT) protein  29.92 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0406  histidine triad (HIT) protein  31.71 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51860  hypothetical protein  27.87 
 
 		 209 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.393091  hitchhiker  0.00413081 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4052  hypothetical protein  24.79 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.663105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1261  histidine triad (HIT) protein  26.83 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0545124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0647  histidine triad (HIT) protein  24.79 
 
 		 142 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.780647  normal  0.90331 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0372  histidine triad (HIT) protein  29.27 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.423054 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0218  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.181658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4549  hypothetical protein  24.62 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0428  histidine triad (HIT) protein  28.05 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0976831  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1085  histidine triad (HIT) protein  28.04 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.986739 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0457  histidine triad (HIT) protein  27.85 
 
 		 146 aa  47.8  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0128148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2506  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0565  histidine triad (HIT) protein  30.38 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.419431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3650  histidine triad (HIT) protein  24.79 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0368  histidine triad (HIT) protein  23.77 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.462248  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4131  histidine triad (HIT) protein  26.88 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190525  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0330  histidine triad (HIT) protein  25.96 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0461  histidine triad (HIT) protein  24.55 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18650  histidine triad (HIT) family protein  23.85 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4120  histidine triad (HIT) protein  25.64 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6061  histidine triad (HIT) protein  28.12 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0865  histidine triad (HIT) protein  25.77 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.577446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  26.09 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0088  histidine triad (HIT) protein  25.58 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.348291  normal  0.0668606 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  26.09 
 
 		 138 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2122  histidine triad (HIT) protein  29.11 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427523  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2761  histidine triad (HIT) protein  29.11 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2734  histidine triad (HIT) protein  29.11 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2792  HIT family hydrolase  27.27 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0119  histidine triad (HIT) protein  24.32 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2626  histidine triad (HIT) protein  30.34 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  28.68 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  26.23 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0345  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  normal  0.426855 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1236  histidine triad (HIT) protein  27.47 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0794  histidine triad (HIT) protein  23.58 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4417  histidine triad (HIT) protein  23.97 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1505  histidine triad (HIT) protein  25.64 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4008  histidine triad (HIT) protein  27.47 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  26.09 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2785  histidine triad (HIT) protein  29.11 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.804661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2652  histidine triad (HIT) protein  29.11 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.627712  normal  0.962372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4211  histidine triad (HIT) protein  22.3 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2587  histidine triad (HIT) protein  28.18 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.458872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2835  HIT family hydrolase  26.36 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0553018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0618  histidine triad (HIT) protein  23.23 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.619143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0681  HIT domain-containing protein  23.08 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0551  HIT domain-containing protein  23.08 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1207  histidine triad (HIT) protein  27.47 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0455  hypothetical protein  25.96 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0184  hypothetical protein  23.08 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0843  HIT family hydrolase  23.08 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4849  histidine triad (HIT) protein  24 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104991  normal  0.870904 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2949  histidine triad (HIT) protein  24.83 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2762  HIT domain-containing protein  23.08 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0604748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0665  HIT domain-containing protein  23.08 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2396  HIT domain-containing protein  23.08 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2316  HIT domain-containing protein  23.08 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.529616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7347  hypothetical protein  24.24 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3986  hypothetical protein  23.08 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0356527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  28.57 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0109  hypothetical protein  26.97 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.648306  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0669  histidine triad (HIT) protein  25.58 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5002  histidine triad (HIT) protein  30.59 
 
 		 141 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2790  HIT family hydrolase  26.36 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125296 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2500  HIT family hydrolase  28.83 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.736271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0020  histidine triad (HIT) protein  29.11 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.089911  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1704  HIT family protein  32.08 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.274737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0230  histidine triad (HIT) protein  26.19 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0035  hypothetical protein  23.64 
 
 		 165 aa  41.2  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.871621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2514  HIT family hydrolase  26.36 
 
 		 183 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00139643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  22.61 
 
 		 138 aa  40.8  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1068  histidine triad (HIT) protein  27.72 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1663  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109838 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0370  histidine triad (HIT) protein  21.74 
 
 		 138 aa  40.8  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.673964 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1483  histidine triad (HIT) family protein  33.33 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0478904 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  28.97 
 
 		 144 aa  40.4  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  25.4 
 
 		 140 aa  40.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  25.4 
 
 		 140 aa  40.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>