More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0043 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0043  phosphate transporter  100 
 
 
331 aa  655    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  53.8 
 
 
332 aa  345  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  51.43 
 
 
332 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  48.48 
 
 
332 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  50.8 
 
 
333 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  49.21 
 
 
333 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  48.32 
 
 
332 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  49.84 
 
 
338 aa  293  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  47.42 
 
 
333 aa  292  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  48.92 
 
 
326 aa  291  9e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  49.84 
 
 
333 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  47.76 
 
 
329 aa  285  7e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  46.88 
 
 
336 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  48.85 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  49.53 
 
 
337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0892  phosphate transporter  47.27 
 
 
334 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2658  phosphate transporter  50 
 
 
332 aa  279  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4358  phosphate transporter  48.5 
 
 
335 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000836516  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2027  phosphate transporter  48.62 
 
 
333 aa  276  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3421  phosphate transporter  49.54 
 
 
337 aa  275  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2817  phosphate transporter  49.01 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.011171 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3585  phosphate transporter  46.2 
 
 
333 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121636  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0563  phosphate transporter family protein  44.62 
 
 
332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0549  phosphate permease  44.62 
 
 
332 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0300  phosphate transporter  50.66 
 
 
332 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.942291  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2499  phosphate transporter  48.48 
 
 
346 aa  269  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.617445  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  46.98 
 
 
336 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0450  phosphate transporter  47.77 
 
 
333 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  0.360764 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1960  phosphate transporter  49.84 
 
 
334 aa  266  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  44.79 
 
 
335 aa  265  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  44.79 
 
 
335 aa  265  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0241  phosphate transporter  46.82 
 
 
334 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0871  phosphate transporter  50.17 
 
 
330 aa  264  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0740  phosphate transporter  45.59 
 
 
336 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2217  phosphate transporter  44.65 
 
 
427 aa  261  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3021  phosphate transporter  48.45 
 
 
332 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0911  phosphate transporter  46.73 
 
 
378 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  47.13 
 
 
385 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10556  low affinity inorganic phosphate transporter integral membrane protein pitA  44.55 
 
 
417 aa  258  9e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0205313  normal  0.167951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0326  phosphate transporter  45.87 
 
 
334 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4259  phosphate transporter  46.54 
 
 
332 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2887  phosphate transporter  43.38 
 
 
370 aa  255  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0283  phosphate transporter  47.3 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0849813 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2876  phosphate transporter  45.85 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2552  phosphate transporter  45.73 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.729981  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1443  phosphate transporter  42.9 
 
 
373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315159  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33540  phosphate/sulfate permease  48.52 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0469788  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2626  phosphate transporter  46.62 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1748  phosphate transporter  49.06 
 
 
332 aa  250  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0493657 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0043  phosphate transporter  42.12 
 
 
331 aa  249  6e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1123  phosphate transporter  42.07 
 
 
335 aa  248  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000161634  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5449  phosphate transporter  45.2 
 
 
386 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0370554  normal  0.318098 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0317  phosphate transporter family protein  44.41 
 
 
336 aa  246  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.178517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2000  phosphate transporter  44.62 
 
 
335 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00181  transport protein  42.66 
 
 
368 aa  246  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1083  phosphate transporter  46.28 
 
 
336 aa  247  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1143  phosphate transporter  44.69 
 
 
380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.639626  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1188  phosphate transporter  45.25 
 
 
336 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198901  normal  0.0620893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1973  phosphate transporter  44.97 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137015  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1249  phosphate transporter  45.25 
 
 
336 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366515  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1313  inorganic phosphate transporter  44.59 
 
 
336 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1508  phosphate transporter family protein  45.76 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0297003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3837  phosphate transporter family protein  45.76 
 
 
332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0211808  hitchhiker  0.000000000133014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1527  phosphate transporter  43.53 
 
 
411 aa  242  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331212  normal  0.0143461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1178  phosphate transporter  44.88 
 
 
332 aa  240  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0843  phosphate transporter  42.68 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1576  phosphate transporter family protein  46.11 
 
 
332 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000371851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1614  phosphate transporter family protein  46.11 
 
 
332 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000923139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1376  phosphate transporter  45.87 
 
 
332 aa  239  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000403006  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0917  phosphate transporter  45.1 
 
 
336 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  normal  0.295731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5168  phosphate transporter  44.66 
 
 
336 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0592  phosphate transporter  44.66 
 
 
336 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1545  phosphate transporter family protein  46.11 
 
 
332 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000352137 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1361  phosphate transporter family protein  46.11 
 
 
332 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000679914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1335  phosphate transporter  46.11 
 
 
332 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000375914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1334  phosphate transporter  46.11 
 
 
332 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000421375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4384  phosphate transporter  45.15 
 
 
352 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.622735  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1471  phosphate transporter family protein  46.11 
 
 
332 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.466845  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1798  phosphate transporter  40.66 
 
 
434 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000136654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1406  phosphate transporter  43.85 
 
 
336 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.596183  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  43.38 
 
 
336 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2057  phosphate transporter  41.27 
 
 
397 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.051228  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4361  phosphate transporter  44.85 
 
 
352 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1470  phosphate transporter  44.2 
 
 
336 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0678  phosphate transporter  42.63 
 
 
336 aa  235  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  43.89 
 
 
336 aa  235  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  43.89 
 
 
336 aa  235  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1684  phosphate transporter  44.41 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00190537  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1777  phosphate transporter  43.22 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4378  phosphate transporter  43.75 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0749407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1805  phosphate transporter  43.22 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4228  phosphate transporter  44.18 
 
 
352 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6211  phosphate transporter  44.37 
 
 
336 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1868  phosphate transporter  44.37 
 
 
336 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1891  phosphate transporter  44.37 
 
 
336 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123921  hitchhiker  0.0000000789991 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1414  phosphate transporter  43.45 
 
 
329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1687  phosphate transporter  44.44 
 
 
336 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  43.75 
 
 
336 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0708  phosphate transporter  39.03 
 
 
417 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146942  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0034  phosphate transporter  41.28 
 
 
333 aa  230  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.81002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>