More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0016 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00100  GTP-binding protein TypA/BipA  65.95 
 
 		 604 aa  835    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000172571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0016  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 612 aa  1249    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000119023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28010  GTP-binding protein TypA/BipA  65.61 
 
 		 603 aa  836    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0013  GTP-binding protein TypA  67.38 
 
 		 603 aa  852    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1239  GTP-binding protein TypA  51.57 
 
 		 611 aa  604  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 616 aa  601  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 613 aa  600  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  48.67 
 
 		 602 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  48.91 
 
 		 602 aa  594  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  48.83 
 
 		 602 aa  594  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3399  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 604 aa  592  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 627 aa  591  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  48.82 
 
 		 592 aa  590  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  49.33 
 
 		 614 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5495  GTP-binding protein TypA  49.33 
 
 		 604 aa  589  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00444175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  48.93 
 
 		 614 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  50.34 
 
 		 593 aa  590  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0130  GTP-binding protein TypA  49.25 
 
 		 601 aa  585  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00979759  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 605 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00185  GTP-binding elongation factor family protein TypA/BipA  48.67 
 
 		 598 aa  582  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  48.75 
 
 		 602 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4935  GTP-binding protein TypA  48.5 
 
 		 598 aa  582  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  48.5 
 
 		 602 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  47.84 
 
 		 602 aa  579  1e-164  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  48.03 
 
 		 607 aa  581  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  47.67 
 
 		 599 aa  580  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0844  GTP-binding protein TypA  48.58 
 
 		 604 aa  579  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.926481 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  48.17 
 
 		 600 aa  581  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  48.09 
 
 		 606 aa  579  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  48.01 
 
 		 600 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0615  GTP-binding protein TypA  48.08 
 
 		 599 aa  575  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  47.49 
 
 		 604 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  47.54 
 
 		 605 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2688  GTP-binding elongation factor  49.5 
 
 		 602 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  47.11 
 
 		 610 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  47.91 
 
 		 613 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4050  GTP-binding protein TypA  48.58 
 
 		 599 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.79027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  48.51 
 
 		 610 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  47.67 
 
 		 600 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  48.93 
 
 		 615 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  48.93 
 
 		 615 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  47.61 
 
 		 610 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  47.61 
 
 		 610 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  48.17 
 
 		 602 aa  575  1.0000000000000001e-162  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  49.92 
 
 		 608 aa  575  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  48.85 
 
 		 615 aa  570  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0153  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 605 aa  571  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  44.7 
 
 		 612 aa  568  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  48.76 
 
 		 609 aa  570  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1518  GTP-binding protein TypA  48.75 
 
 		 608 aa  570  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.678291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  49.42 
 
 		 603 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  48.59 
 
 		 605 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  47.92 
 
 		 598 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  47.23 
 
 		 614 aa  567  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0953  GTP-binding protein TypA  48.25 
 
 		 608 aa  567  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  48.58 
 
 		 608 aa  565  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  47.34 
 
 		 606 aa  566  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  49 
 
 		 608 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  48.09 
 
 		 605 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  48.85 
 
 		 608 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  49.33 
 
 		 606 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  46.74 
 
 		 614 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2717  GTP-binding protein TypA  46.9 
 
 		 613 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  48.67 
 
 		 608 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  46.74 
 
 		 614 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  46.74 
 
 		 614 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  46.74 
 
 		 614 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  46.74 
 
 		 614 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  48.67 
 
 		 608 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  48.12 
 
 		 613 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  48.83 
 
 		 608 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  49.42 
 
 		 606 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  46.58 
 
 		 614 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  48.67 
 
 		 608 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  46.46 
 
 		 609 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  48.67 
 
 		 608 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  46.78 
 
 		 607 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  46.74 
 
 		 614 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  48.83 
 
 		 606 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  48.67 
 
 		 608 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  48.85 
 
 		 608 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  48.67 
 
 		 608 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  49.67 
 
 		 607 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  47.33 
 
 		 599 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  46.74 
 
 		 614 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  47.82 
 
 		 608 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  48.59 
 
 		 602 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  46.74 
 
 		 614 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  48.67 
 
 		 608 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  46.74 
 
 		 614 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  48.34 
 
 		 608 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  46.83 
 
 		 601 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  47.75 
 
 		 609 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  48.83 
 
 		 606 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  47.85 
 
 		 632 aa  560  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4267  GTP-binding protein TypA  47.08 
 
 		 615 aa  559  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0798314 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  47.88 
 
 		 615 aa  558  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  46.43 
 
 		 608 aa  558  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  47.15 
 
 		 596 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  47.25 
 
 		 601 aa  558  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>