More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0002 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 		 509 aa  1056    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.988303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.33 
 
 		 501 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000175242  decreased coverage  0.000074483 
 
 
-
 
NC_002978  WD0001  chromosomal replication initiation protein  34.43 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.335135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.06 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  33.25 
 
 		 450 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  33.25 
 
 		 448 aa  221  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  29.41 
 
 		 495 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  30.84 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  28.57 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  33.8 
 
 		 451 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  34.64 
 
 		 452 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  33.6 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  33.7 
 
 		 457 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  33.86 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  32.87 
 
 		 457 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  30.45 
 
 		 446 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  34.08 
 
 		 453 aa  217  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  34.08 
 
 		 453 aa  217  5e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  33.61 
 
 		 524 aa  217  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  30.6 
 
 		 446 aa  217  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  35 
 
 		 506 aa  217  5e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.993036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.18 
 
 		 453 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  30.37 
 
 		 446 aa  216  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.63 
 
 		 446 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 446 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 446 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 446 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 446 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 446 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  31.57 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 446 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  32.8 
 
 		 442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  35.35 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 446 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  33.24 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  33.24 
 
 		 460 aa  213  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  34.32 
 
 		 461 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  30.69 
 
 		 467 aa  213  9e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0391  chromosomal replication initiation protein  36.86 
 
 		 524 aa  212  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246214  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  30.69 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.69 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  30.63 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  30.69 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  31.47 
 
 		 466 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  30.69 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  34.9 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  30.69 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.88 
 
 		 520 aa  212  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000222997  hitchhiker  0.00000014852 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  30.82 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  30.69 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  30.82 
 
 		 460 aa  211  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  34.33 
 
 		 450 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.15 
 
 		 454 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  34.55 
 
 		 443 aa  211  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  32.49 
 
 		 449 aa  211  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  34.33 
 
 		 462 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  34.33 
 
 		 462 aa  211  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  30.34 
 
 		 460 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  32.12 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  34.06 
 
 		 465 aa  210  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.55 
 
 		 516 aa  210  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000003522  unclonable  0.00000000000722922 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  31.27 
 
 		 466 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  31.27 
 
 		 466 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  35.48 
 
 		 455 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  31.27 
 
 		 466 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  35.48 
 
 		 455 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  31.27 
 
 		 466 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  33.01 
 
 		 443 aa  210  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  34.25 
 
 		 467 aa  210  6e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 461 aa  210  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  32.13 
 
 		 440 aa  209  7e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  32.18 
 
 		 465 aa  209  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  30.34 
 
 		 460 aa  209  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00002  Chromosomal replication initiator protein dnaA  33.61 
 
 		 533 aa  209  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000917685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 462 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 462 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 462 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  31.53 
 
 		 470 aa  209  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 462 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0001  chromosomal replication initiation protein  35.97 
 
 		 454 aa  208  1e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.35 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.15 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  33.15 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.25 
 
 		 483 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.35 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  28.26 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  28.26 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  30.14 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0001  chromosomal replication initiation protein  33.7 
 
 		 475 aa  207  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  29.94 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_007964  Nham_0001  chromosomal replication initiation protein  33.98 
 
 		 475 aa  207  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  33.82 
 
 		 451 aa  206  6e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  33.82 
 
 		 451 aa  206  6e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.87 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0001  chromosomal replication initiation protein  32.51 
 
 		 579 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.86 
 
 		 474 aa  205  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0537995  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0001  chromosomal replication initiation protein  34.23 
 
 		 516 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962631  hitchhiker  0.00495499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  29.28 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  33.7 
 
 		 472 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1436  chromosomal replication initiation protein  33.05 
 
 		 500 aa  205  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>