299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_R0028 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_R0028  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763177  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0021  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.713807  normal  0.0150575 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0022  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0028  tRNA-Gly  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0006  tRNA-Gly  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.285278  hitchhiker  0.0000641182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0066  tRNA-Gly  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00320497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0025  tRNA-Gly  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0001  tRNA-Gly  93.24 
 
 
76 bp  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0654082  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0022  tRNA-Gly  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0368562  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0012  tRNA-Gly  93.51 
 
 
77 bp  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0572972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0027  tRNA-Gly  93.15 
 
 
73 bp  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0012  tRNA-Gly  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000114825  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0044  tRNA-Gly  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000615289  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0050  tRNA-Gly  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0015  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.5531599999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0017  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000311098  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1327  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0266697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0009  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0539709  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1467  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000429546  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0015  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000519668  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1718  tRNA-Gly  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000351586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  92.11 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0003  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  92.11 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  92.11 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0003  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  92.11 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  92.11 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0003  tRNA-Gly  90.79 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  92.11 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  92.11 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  90.67 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07725  tRNA-Gly  94.92 
 
 
73 bp  93.7  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0438  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0049  tRNA-Gly  90.41 
 
 
73 bp  89.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119188  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2232  tRNA-Gly  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000940116  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1674  tRNA-Gly  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000649019  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2192  tRNA-Gly  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000563667  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0046  tRNA-Gly  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0761072  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0044  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0032  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  90.79 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0019  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0051  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0021  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  89.86 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0025  tRNA-Gly  89.61 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42192  normal  0.527647 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0056  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0038  tRNA-Gly  89.47 
 
 
75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0028  tRNA-Gly  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-5  tRNA-Ser  94.12 
 
 
67 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0048  tRNA-Gly  88 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000333522  normal  0.379894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0046  tRNA-Gly  91.53 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0039  tRNA-OTHER  97.62 
 
 
71 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.022052  normal  0.0225653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0806  hypothetical protein  97.62 
 
 
108 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000935428 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0011  tRNA-Gly  88.31 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000446743  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0009  tRNA-Gly  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723102  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0061  tRNA-Gly  88.31 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0004  tRNA-Gly  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0003  tRNA-Gly  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  88.41 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0049  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  88.24 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0016  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.867595  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0053  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0020  tRNA-Gly  88.16 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0018  tRNA-Gly  89.83 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0002  tRNA-Gly  89.83 
 
 
75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0100  tRNA-Gly  87.84 
 
 
75 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682719 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0020  tRNA-Gly  92 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0669163 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0014  tRNA-Gly  88.57 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  89.66 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0037  tRNA-OTHER  95.24 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125942  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0012  tRNA-Gly  87.67 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000602687  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0017  tRNA-Gly  87.67 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000137246  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0009  tRNA-Gly  87.67 
 
 
72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000199446  normal  0.87079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0013  tRNA-Gly  87.67 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0034  tRNA-Gly  86.3 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0015  tRNA-Gly  87.01 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0040  tRNA-Gly  87.01 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0026  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0039  tRNA-Gly  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.936837  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1639  tRNA-Val  89.29 
 
 
78 bp  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.42917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0506  tRNA-Val  89.29 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000210489  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.664304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.89126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  61.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.356708  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0026  tRNA-Val  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000263702  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0040  tRNA-Val  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000028212  normal  0.502069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>