More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_4308 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4308  pseudouridine synthase, RluA family  100 
 
 
323 aa  643  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4330  pseudouridine synthase, RluA family  98.14 
 
 
323 aa  634  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4177  pseudouridine synthase, RluD  96.23 
 
 
318 aa  613  1e-174  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.463318  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4321  RluA family pseudouridine synthase  84.38 
 
 
350 aa  530  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4953  pseudouridine synthase, RluA family  45.14 
 
 
369 aa  242  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0912  pseudouridine synthase, RluA family  38.04 
 
 
558 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00634483 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0261  pseudouridine synthase  29.57 
 
 
336 aa  152  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.39633e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0061  pseudouridine synthase, RluA family  35.8 
 
 
339 aa  146  4e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0073  pseudouridine synthase, RluA family  35.49 
 
 
339 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0056  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.8 
 
 
339 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1379  pseudouridine synthase, RluA family  35.67 
 
 
370 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  37.03 
 
 
541 aa  141  1e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0059  RluA family pseudouridine synthase  37.07 
 
 
339 aa  142  1e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.14313 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0896  pseudouridine synthase  42.31 
 
 
251 aa  141  1e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.925257 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2253  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.58 
 
 
391 aa  141  2e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391915  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1447  pseudouridine synthase, RluD  32.59 
 
 
578 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2882  RluA family pseudouridine synthase  34.3 
 
 
300 aa  140  4e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  34.29 
 
 
318 aa  139  9e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  33.86 
 
 
400 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0967  RluA family pseudouridine synthase  34.15 
 
 
436 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2588  pseudouridine synthase, RluA family  33.33 
 
 
325 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1731  RluA family pseudouridine synthase  34.71 
 
 
405 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1704  RluA family pseudouridine synthase  34.71 
 
 
407 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0998  pseudouridine synthase, RluA family  35.51 
 
 
547 aa  137  3e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.012801 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1817  RluA family pseudouridine synthase  34.41 
 
 
360 aa  137  3e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294999 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0372  pseudouridine synthase, RluA family  33.85 
 
 
334 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0061  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.17 
 
 
321 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102185  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1793  RluA family pseudouridine synthase  34.41 
 
 
402 aa  135  6e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6286  pseudouridine synthase, RluD  34.41 
 
 
402 aa  135  6e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1219  pseudouridine synthase, RluA family  31.09 
 
 
342 aa  134  1e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0969  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.59 
 
 
324 aa  135  1e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1600  pseudouridine synthase, RluA family  32.38 
 
 
525 aa  134  2e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.220651  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0984  pseudouridine synthase, RluA family  35.76 
 
 
320 aa  134  2e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0148654  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  34.86 
 
 
325 aa  134  2e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2406  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.28 
 
 
335 aa  134  2e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0234677  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.37 
 
 
313 aa  134  2e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1344  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.58 
 
 
403 aa  134  2e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.7 
 
 
318 aa  134  2e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5094  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.76 
 
 
402 aa  134  2e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0657  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.89 
 
 
320 aa  134  2e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  29.45 
 
 
306 aa  134  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0663  RluA family pseudouridine synthase  31.58 
 
 
352 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0669  RluA family pseudouridine synthase  31.27 
 
 
352 aa  133  4e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2550  pseudouridine synthase, RluD  32.81 
 
 
319 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.347335  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11940  Pseudouridine synthase  34.08 
 
 
336 aa  132  7e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0988  RluA family pseudouridine synthase  32.08 
 
 
334 aa  132  8e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0665  hypothetical protein  29.43 
 
 
341 aa  132  9e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0348  RluA family pseudouridine synthase  35.45 
 
 
346 aa  131  1e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  31.65 
 
 
311 aa  131  1e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0315  pseudouridine synthase  37.3 
 
 
264 aa  131  1e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2719  RluA family pseudouridine synthase  34.17 
 
 
332 aa  131  1e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.344852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  34.71 
 
 
331 aa  132  1e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1429  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.37 
 
 
327 aa  130  2e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.550632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  32.92 
 
 
310 aa  131  2e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6759  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.56 
 
 
326 aa  131  2e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1353  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.41 
 
 
403 aa  130  2e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270637  normal  0.743014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3159  pseudouridine synthase, RluA family  35.2 
 
 
329 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0992  RluA family pseudouridine synthase  31.96 
 
 
316 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  31.33 
 
 
311 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2003  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.87 
 
 
334 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.704766  normal  0.26865 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2168  RluA family pseudouridine synthase  34.94 
 
 
389 aa  130  4e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1084  RluA family pseudouridine synthase  34.94 
 
 
389 aa  130  4e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.346306  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5641  RluA family pseudouridine synthase  34.49 
 
 
334 aa  130  4e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0784245  normal  0.0662389 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2333  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.94 
 
 
395 aa  130  4e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2205  RluA family pseudouridine synthase  34.94 
 
 
395 aa  130  4e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0083  RluA family pseudouridine synthase  34.94 
 
 
389 aa  130  4e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1324  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.94 
 
 
395 aa  130  4e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1813  RluA family pseudouridine synthase  34.94 
 
 
389 aa  130  4e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587957  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60210  pseudouridine synthase  33.33 
 
 
320 aa  130  4e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35219e-10 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1324  pseudouridine synthase, RluA family  31.29 
 
 
328 aa  129  5e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0827  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.78 
 
 
320 aa  129  5e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.587851  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.02 
 
 
318 aa  129  5e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0947  pseudouridine synthase, RluA family  37.86 
 
 
345 aa  129  5e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.48756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2346  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.62 
 
 
438 aa  129  7e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0455755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04873  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.29 
 
 
333 aa  129  8e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0593  pseudouridine synthase, RluA family  33.88 
 
 
310 aa  129  8e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.070842  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0431  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.88 
 
 
319 aa  129  8e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5183  pseudouridine synthase  33.33 
 
 
320 aa  129  8e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.521194  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1985  RluA family pseudouridine synthase  34.4 
 
 
377 aa  128  1e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122684  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  35.56 
 
 
327 aa  128  1e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1041  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C protein  32.08 
 
 
331 aa  128  1e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.017285  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2308  pseudouridine synthase, RluA family  36.42 
 
 
342 aa  128  1e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0359  pseudouridine synthase RluD  34.42 
 
 
426 aa  128  1e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  1.04546e-05 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.23 
 
 
322 aa  128  1e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1893  pseudouridine synthase, RluA family  33.33 
 
 
345 aa  128  1e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0593  pseudouridine synthase, RluA family  30.43 
 
 
299 aa  127  2e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.35687e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0726  pseudouridine synthase, RluD  31.78 
 
 
320 aa  128  2e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4836  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.78 
 
 
320 aa  128  2e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2431  pseudouridine synthase, RluD  34.01 
 
 
351 aa  127  2e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0293774 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2390  pseudouridine synthase, RluA family  29.55 
 
 
302 aa  127  2e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.837448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.94 
 
 
334 aa  128  2e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3146  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.54 
 
 
343 aa  127  2e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19664  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1841  pseudouridine synthase, RluA family  33.54 
 
 
431 aa  128  2e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.168334 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2859  pseudouridine synthase, RluD  39.58 
 
 
264 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1919  pseudouridine synthase, RluA family  33.44 
 
 
370 aa  126  4e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338974  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6848  RluA family pseudouridine synthase  33.75 
 
 
336 aa  126  4e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3196  RluA family pseudouridine synthase  30.55 
 
 
315 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0921  RluA family pseudouridine synthase  34.01 
 
 
318 aa  126  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1591  pseudouridine synthase, RluA family  33.23 
 
 
370 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  decreased coverage  0.00904495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5026  RluA family pseudouridine synthase  33.96 
 
 
356 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.257508  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>