More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_4173 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4200  tryptophan synthase subunit beta  98.23 
 
 
434 aa  790    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0203217  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4057  tryptophan synthase subunit beta  97.98 
 
 
431 aa  788    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4173  tryptophan synthase subunit beta  100 
 
 
432 aa  865    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0371  tryptophan synthase subunit beta  82.52 
 
 
426 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.197532 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1186  tryptophan synthase subunit beta  67.62 
 
 
394 aa  537  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00284462  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0093  tryptophan synthase subunit beta  63.78 
 
 
410 aa  532  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1451  tryptophan synthase subunit beta  65.64 
 
 
414 aa  522  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  65.81 
 
 
409 aa  523  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1337  tryptophan synthase subunit beta  66.24 
 
 
401 aa  521  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130625  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1693  tryptophan synthase subunit beta  65.56 
 
 
405 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738848  hitchhiker  0.000000703836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3954  tryptophan synthase subunit beta  64.27 
 
 
406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.291144  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2110  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 
406 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0459587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3237  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 
406 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  63.87 
 
 
409 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  65.04 
 
 
410 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  64.78 
 
 
406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0810  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 
406 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4281  tryptophan synthase subunit beta  64.27 
 
 
406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486908  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  64.27 
 
 
406 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2026  tryptophan synthase subunit beta  64.52 
 
 
422 aa  513  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00854562  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1549  tryptophan synthase subunit beta  62.63 
 
 
402 aa  512  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  64.25 
 
 
405 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3216  tryptophan synthase, beta subunit  64.19 
 
 
449 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28100  tryptophan synthase subunit beta  63.92 
 
 
406 aa  509  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54821  normal  0.926175 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  66.58 
 
 
395 aa  509  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0020  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 
406 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  64.08 
 
 
405 aa  505  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  64.9 
 
 
402 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  62.85 
 
 
404 aa  505  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0755  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 
414 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0666  tryptophan synthase subunit beta  63.33 
 
 
406 aa  508  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1074  tryptophan synthase subunit beta  63.84 
 
 
425 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.32093  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3427  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 
408 aa  502  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.76011  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01270  tryptophan synthase subunit beta  63.31 
 
 
405 aa  502  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1549  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 
401 aa  501  1e-141  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1149  tryptophan synthase subunit beta  61.22 
 
 
397 aa  503  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2940  Tryptophan synthase  62.82 
 
 
414 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1361  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 
397 aa  501  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1161  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 
397 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 
397 aa  499  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 
397 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3174  tryptophan synthase, beta subunit  63.54 
 
 
405 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1296  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 
397 aa  498  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  62.47 
 
 
394 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0215  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 
391 aa  498  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1253  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 
397 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0147  tryptophan synthase subunit beta  62.16 
 
 
417 aa  498  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  64.42 
 
 
428 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 
403 aa  500  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0197  tryptophan synthase subunit beta  63.24 
 
 
404 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1211  tryptophan synthase subunit beta  62.21 
 
 
396 aa  498  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  60.97 
 
 
397 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1328  tryptophan synthase subunit beta  62.56 
 
 
404 aa  499  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.000691779  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  62.6 
 
 
411 aa  498  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1291  tryptophan synthase subunit beta  61.66 
 
 
397 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  62.86 
 
 
396 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3791  tryptophan synthase subunit beta  63.27 
 
 
410 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.0231351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  62.98 
 
 
407 aa  498  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1412  tryptophan synthase subunit beta  60.69 
 
 
394 aa  495  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00140909  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0118  tryptophan synthase subunit beta  60.86 
 
 
413 aa  494  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20740  tryptophan synthase, beta chain  62.63 
 
 
415 aa  495  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133254  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1398  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 
397 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.369323  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5701  tryptophan synthase subunit beta  63.97 
 
 
411 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.194969  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3321  tryptophan synthase subunit beta  61.18 
 
 
396 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000386703  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 
397 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  61.65 
 
 
413 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1872  tryptophan synthase subunit beta  61.62 
 
 
413 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0911585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  60.77 
 
 
411 aa  495  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0176  tryptophan synthase subunit beta  60.86 
 
 
430 aa  495  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 
397 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 
397 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 
404 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  61.15 
 
 
413 aa  496  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 
397 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2947  tryptophan synthase, beta subunit  59.23 
 
 
455 aa  495  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.378076  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 
397 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  62.69 
 
 
397 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2817  tryptophan synthase subunit beta  62.21 
 
 
420 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.046962  normal  0.771537 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  60.26 
 
 
391 aa  495  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  61.17 
 
 
409 aa  491  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  59.18 
 
 
409 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  59.44 
 
 
409 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0432  tryptophan synthase subunit beta  61.24 
 
 
424 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3599  tryptophan synthase subunit beta  62.21 
 
 
420 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213092  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1914  tryptophan synthase subunit beta  61.83 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148244  normal  0.536089 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1727  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.476833  hitchhiker  0.00551797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  61.17 
 
 
413 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  62.15 
 
 
404 aa  493  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  62.44 
 
 
397 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  61.93 
 
 
418 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0635  tryptophan synthase subunit beta  61.95 
 
 
404 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.874907  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2069  tryptophan synthase subunit beta  61.13 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.166636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  62.72 
 
 
405 aa  492  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0467  tryptophan synthase subunit beta  61.5 
 
 
424 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.826366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2467  tryptophan synthase subunit beta  62.95 
 
 
407 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.379928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0201  tryptophan synthase subunit beta  61.62 
 
 
413 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445286  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  60.51 
 
 
402 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3075  tryptophan synthase subunit beta  63.45 
 
 
423 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000212067  hitchhiker  0.000123729 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  62.18 
 
 
397 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0103  tryptophan synthase subunit beta  60.71 
 
 
410 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>