More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3713 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3796  NADH dehydrogenase (quinone)  98.01 
 
 
654 aa  1199    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  95.57 
 
 
654 aa  875    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3713  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
654 aa  1220    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.117424  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  71.48 
 
 
654 aa  729    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  48.63 
 
 
669 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  50.43 
 
 
669 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  43.84 
 
 
669 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  50.17 
 
 
668 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  47.6 
 
 
666 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  48.37 
 
 
667 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  47.87 
 
 
666 aa  458  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  47.41 
 
 
662 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  51.45 
 
 
663 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2601  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.44 
 
 
660 aa  438  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  44.66 
 
 
661 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  45.05 
 
 
666 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  45.71 
 
 
577 aa  422  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.41 
 
 
659 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.07 
 
 
659 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  42.48 
 
 
646 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  41.37 
 
 
665 aa  364  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  39.15 
 
 
673 aa  355  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  37.97 
 
 
672 aa  342  1e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  42.4 
 
 
671 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  48.97 
 
 
666 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  38.63 
 
 
723 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  45.1 
 
 
679 aa  323  7e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  43.3 
 
 
672 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  43.3 
 
 
672 aa  320  5e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  43.53 
 
 
672 aa  320  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  43.3 
 
 
672 aa  320  7e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  43.3 
 
 
672 aa  320  7e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  46.53 
 
 
673 aa  319  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  41.4 
 
 
687 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  42.63 
 
 
672 aa  317  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  39.2 
 
 
669 aa  312  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0166  hydrogenase 4 subunit B  40.3 
 
 
681 aa  309  9e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970512  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  42.03 
 
 
748 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  38.07 
 
 
683 aa  305  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  37.82 
 
 
674 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  53.23 
 
 
666 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.92 
 
 
661 aa  303  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  39.08 
 
 
669 aa  302  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  39.64 
 
 
682 aa  301  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  35.29 
 
 
644 aa  300  5e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  53.27 
 
 
665 aa  297  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  40.61 
 
 
669 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  31.29 
 
 
662 aa  294  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  37.19 
 
 
655 aa  293  5e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  35.93 
 
 
617 aa  293  8e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  38.31 
 
 
669 aa  292  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  34.79 
 
 
644 aa  291  3e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  42.71 
 
 
672 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34 
 
 
688 aa  289  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  40.75 
 
 
672 aa  287  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  37.75 
 
 
674 aa  287  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  37.4 
 
 
649 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  39.09 
 
 
674 aa  281  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  36.02 
 
 
637 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  41.84 
 
 
737 aa  278  3e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  36.15 
 
 
643 aa  277  6e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  33.16 
 
 
655 aa  276  1.0000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  39.77 
 
 
668 aa  275  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  39.52 
 
 
671 aa  272  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3276  NADH dehydrogenase (quinone)  35.06 
 
 
671 aa  270  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  31.38 
 
 
650 aa  270  5.9999999999999995e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  39.67 
 
 
668 aa  267  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  39.67 
 
 
668 aa  267  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3780  NADH dehydrogenase (quinone)  47.17 
 
 
670 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0116247  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1807  hydrogenase 4 subunit B  41.53 
 
 
660 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370569  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2149  hydrogenase 4 subunit B  41.53 
 
 
660 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.33721  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  31.36 
 
 
633 aa  244  3e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4703  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.18 
 
 
662 aa  239  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  32.89 
 
 
674 aa  232  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.65 
 
 
646 aa  231  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000307213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4469  NADH dehydrogenase (quinone)  41.26 
 
 
664 aa  230  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  37.31 
 
 
640 aa  229  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3196  formate hydrogenlyase subunit 3  36.02 
 
 
608 aa  227  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3974  formate hydrogenlyase subunit 3  37.02 
 
 
608 aa  226  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0966  NADH dehydrogenase (quinone)  36.79 
 
 
608 aa  226  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3054  formate hydrogenlyase subunit 3  36.88 
 
 
608 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.920212  normal  0.22505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2848  formate hydrogenlyase subunit 3  37.02 
 
 
608 aa  226  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.264273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3011  formate hydrogenlyase subunit 3  37.02 
 
 
608 aa  225  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02573  NADH dehydrogenase subunit N  36.79 
 
 
608 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.621394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2859  formate hydrogenlyase subunit 3  36.79 
 
 
608 aa  225  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0989  formate hydrogenlyase subunit 3  36.79 
 
 
608 aa  225  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.180245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2972  formate hydrogenlyase subunit 3  36.88 
 
 
608 aa  217  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3003  formate hydrogenlyase subunit 3  36.88 
 
 
608 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3161  formate hydrogenlyase subunit 3  36.66 
 
 
608 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3038  formate hydrogenlyase subunit 3  36.66 
 
 
608 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2985  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.02 
 
 
674 aa  203  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0690807  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2432  NADH dehydrogenase (quinone)  42.82 
 
 
622 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  31.69 
 
 
633 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  31.69 
 
 
633 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.96 
 
 
959 aa  193  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  33.04 
 
 
500 aa  192  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.95 
 
 
966 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  34.75 
 
 
1264 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.71 
 
 
997 aa  184  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0184  NADH dehydrogenase (quinone)  33.73 
 
 
487 aa  184  6e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>