62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3666 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3666  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  100 
 
 
250 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.486976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3741  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  98 
 
 
250 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3600  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  93.89 
 
 
250 aa  344  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0536  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  51.05 
 
 
251 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  28.8 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4396  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  33.03 
 
 
239 aa  92.4  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809922  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0006  pilus chaperone protein, putative  29.61 
 
 
247 aa  88.6  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0007  chaperone protein EcpD  29.61 
 
 
247 aa  88.6  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00437464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0305  chaperone protein pmfD, putative  29.91 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2340  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  34.76 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1269  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  32.49 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0558339  normal  0.0398715 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  33.82 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01137  pili assembly chaperone  30.37 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0327551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1070  putative pilus assembly chaperone  33.2 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2474  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  34.27 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1222  hypothetical protein  33.2 
 
 
236 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0722  hypothetical protein  33.2 
 
 
236 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278946  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1606  hypothetical protein  33.2 
 
 
236 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2993  hypothetical protein  33.2 
 
 
236 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.810791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2293  hypothetical protein  33.2 
 
 
236 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1063  P pilus assembly protein, chaperone PapD  33.77 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  28.85 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5758  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  34.58 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_003296  RS03042  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  36.55 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168941  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  31.44 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0866  hypothetical protein  32.88 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  34.3 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  34.03 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0145  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  30.31 
 
 
262 aa  65.1  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195396  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  29.86 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2460  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  28.1 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0611  chaperone protein PmfD, putative  26.75 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000224808  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4601  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  31.73 
 
 
288 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  31.15 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2361  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  30.09 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200412  normal  0.497633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3334  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  30.09 
 
 
258 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1961  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  28.63 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2818  putative fimbrial chaperone  26.14 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001217  pilus assembly protein chaperone PapD  28.26 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1801  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  29.66 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109168  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5510  putative fimbrial chaperone protein  27.59 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2109  putative chaperone protein  26.57 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024073 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1664  pilus assembly chaperone  25.86 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2670  pilus assembly chaperone  25.86 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  24.71 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1775  chaperone protein  25.86 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0765  hypothetical protein  25.66 
 
 
250 aa  52  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1096  hypothetical protein  24.47 
 
 
283 aa  49.3  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000563726  normal  0.588857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3670  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  26.99 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295639  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1104  hypothetical protein  27.22 
 
 
271 aa  46.6  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176891  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2678  fimbrial assembly chaperone, putative  28.83 
 
 
279 aa  45.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61530  putative pili assembly chaperone  29.32 
 
 
262 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1792  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  27.03 
 
 
279 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1635  fimbrial chaperone protein  27.03 
 
 
279 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1613  type I pilus usher pathway chaperone CsuC  27.03 
 
 
279 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0478  putative fimbrial assembly chaperone  27.03 
 
 
280 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5300  putative pili assembly chaperone  28.8 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0680  putative fimbrial assembly chaperone  27.03 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0875  fimbrial assembly chaperone, putative  27.03 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1398  putative fimbrial assembly chaperone  27.03 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3163  hypothetical protein  26.96 
 
 
323 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2625  hypothetical protein  27.23 
 
 
319 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>