More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3538 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  99.78 
 
 
462 aa  906  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  97.4 
 
 
462 aa  871  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  100 
 
 
462 aa  907  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3565  DNA repair protein RadA  87.88 
 
 
471 aa  738  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  0.041039 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  61.18 
 
 
450 aa  531  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.97198e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  57.05 
 
 
453 aa  516  1e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  7.66532e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  57.17 
 
 
449 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  57.14 
 
 
448 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  58.02 
 
 
460 aa  510  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85269e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  56.48 
 
 
458 aa  506  1e-142  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  56.07 
 
 
458 aa  502  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  56.07 
 
 
458 aa  502  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  56.07 
 
 
458 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  56.07 
 
 
458 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  55.82 
 
 
458 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  55.82 
 
 
458 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  56.07 
 
 
458 aa  502  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  56.07 
 
 
458 aa  501  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  56.07 
 
 
458 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  57.08 
 
 
450 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  55.6 
 
 
458 aa  500  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  57.4 
 
 
453 aa  498  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  52.52 
 
 
454 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  55.24 
 
 
484 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  53.29 
 
 
457 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  52.88 
 
 
452 aa  478  1e-133  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  54.3 
 
 
449 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  52.65 
 
 
470 aa  471  1e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  54.07 
 
 
452 aa  468  1e-130  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 
454 aa  458  1e-128  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  50.33 
 
 
454 aa  458  1e-128  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  52.98 
 
 
449 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3182  DNA repair protein RadA  53.42 
 
 
465 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.540345 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  48.9 
 
 
457 aa  450  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  49.67 
 
 
457 aa  450  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  52.97 
 
 
448 aa  449  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  51.76 
 
 
453 aa  446  1e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  49.56 
 
 
454 aa  448  1e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  50 
 
 
453 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  46.46 
 
 
457 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  50.22 
 
 
457 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  48.07 
 
 
514 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  48.07 
 
 
514 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  52.4 
 
 
489 aa  441  1e-122  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  50.77 
 
 
453 aa  439  1e-122  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  49.01 
 
 
446 aa  435  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  48.07 
 
 
520 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  48.25 
 
 
459 aa  433  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02144e-10 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  52.42 
 
 
451 aa  433  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  49.24 
 
 
462 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  45.41 
 
 
458 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  51.1 
 
 
452 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  46.87 
 
 
453 aa  428  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  54.69 
 
 
445 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 
465 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  48.9 
 
 
462 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0158  DNA repair protein RadA  47.9 
 
 
456 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00234882  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  50 
 
 
447 aa  425  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  49.09 
 
 
457 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  47.17 
 
 
507 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  47.65 
 
 
453 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  47.93 
 
 
451 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.21912e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  45.53 
 
 
455 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  46.31 
 
 
457 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  49.23 
 
 
464 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  48.79 
 
 
476 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  50 
 
 
462 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  47.25 
 
 
461 aa  416  1e-115  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  53.52 
 
 
408 aa  416  1e-115  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  48.68 
 
 
460 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4640  DNA repair protein RadA  50.22 
 
 
455 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  50.76 
 
 
455 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  45.42 
 
 
518 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  46.07 
 
 
461 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  50.44 
 
 
455 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  45.51 
 
 
453 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  45.51 
 
 
453 aa  411  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  45.45 
 
 
517 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0756  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 
453 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.752  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  44.37 
 
 
451 aa  411  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  2.62714e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03370  DNA repair protein RadA  46.49 
 
 
459 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0626  DNA repair protein RadA  45.83 
 
 
459 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04265  predicted repair protein  47.29 
 
 
460 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04230  hypothetical protein  47.29 
 
 
460 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002636  DNA repair protein RadA  46.27 
 
 
459 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00949545  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5903  DNA repair protein RadA  47.29 
 
 
460 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4936  DNA repair protein RadA  47.29 
 
 
460 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4938  DNA repair protein RadA  47.29 
 
 
460 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.664332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3667  DNA repair protein RadA  47.29 
 
 
460 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.696085 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3609  DNA repair protein RadA  47.29 
 
 
460 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0510  DNA repair protein RadA  48.37 
 
 
458 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150975  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4988  DNA repair protein RadA  47.29 
 
 
460 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4624  DNA repair protein RadA  47.29 
 
 
460 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2814  DNA repair protein RadA  45.35 
 
 
454 aa  405  1e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  49.45 
 
 
456 aa  405  1e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0423  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 
448 aa  405  1e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0841  DNA repair protein RadA  50 
 
 
457 aa  407  1e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4991  DNA repair protein RadA  47.07 
 
 
460 aa  405  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4830  DNA repair protein RadA  47.07 
 
 
460 aa  405  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5249  DNA repair protein RadA  50 
 
 
453 aa  408  1e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>