69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3341 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1368  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000513137  normal  0.127219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0810  transcriptional regulator  44.07 
 
 
79 aa  51.6  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0185254  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  49.12 
 
 
158 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  28.78 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 
383 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  31.15 
 
 
134 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2158  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
239 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233392  normal  0.181964 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0890  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 
77 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
304 aa  47.8  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.68 
 
 
376 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 
156 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  42.11 
 
 
377 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 
72 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1454  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 
116 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
192 aa  45.8  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2992  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 
188 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.537679  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3063  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 
201 aa  45.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4055  molybdate metabolism transcriptional regulator  40.35 
 
 
377 aa  45.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00182658  normal  0.26319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
110 aa  45.8  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.37 
 
 
120 aa  45.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  45.76 
 
 
75 aa  45.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06790  hypothetical protein  38.98 
 
 
187 aa  45.4  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3903  transcriptional regulator, XRE family protein  28.14 
 
 
511 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 
76 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.37 
 
 
119 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 
436 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  33.64 
 
 
404 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  31.03 
 
 
145 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0574  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0615681  hitchhiker  0.00000129991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  29.63 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  31.15 
 
 
201 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
505 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1588  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 
147 aa  43.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0186285  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5814  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
193 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 
72 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1419  Cro/CI family transcriptional regulator  43.55 
 
 
142 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2821  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 
181 aa  42.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0738374  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  26.6 
 
 
143 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 
91 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 
189 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
147 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
252 aa  42.4  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 
208 aa  42  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
193 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
193 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
193 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
91 aa  42  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3471  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 
197 aa  42  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  40.68 
 
 
192 aa  42  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  27.91 
 
 
178 aa  42  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 
93 aa  41.6  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1136  DNA-binding protein  45.45 
 
 
101 aa  42  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.632905  normal  0.0362151 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 
178 aa  42  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3743  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 
231 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0174083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  28.46 
 
 
371 aa  42  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2138  XRE family transcriptional regulator  26.96 
 
 
231 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 
84 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0506  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 
194 aa  41.6  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0504214  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  30.77 
 
 
104 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.033693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>