238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3180 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  94.33 
 
 
547 aa  1005    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  76.45 
 
 
540 aa  811    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
543 aa  1086    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  97.61 
 
 
543 aa  1038    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.44 
 
 
556 aa  488  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  53.05 
 
 
546 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  48.59 
 
 
632 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  48.59 
 
 
632 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  48.59 
 
 
632 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  48.41 
 
 
552 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  48.05 
 
 
696 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  48.41 
 
 
653 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  48.41 
 
 
632 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  48.41 
 
 
632 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  49.54 
 
 
591 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  49.54 
 
 
591 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  49.54 
 
 
591 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  49.26 
 
 
657 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.91 
 
 
583 aa  448  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.65 
 
 
623 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  48.91 
 
 
564 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  47.88 
 
 
578 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  50.28 
 
 
563 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  49.19 
 
 
622 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  47.63 
 
 
578 aa  438  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  47.58 
 
 
578 aa  437  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.47 
 
 
557 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.02 
 
 
537 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  47.88 
 
 
569 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  46.85 
 
 
587 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  48.62 
 
 
577 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  50.09 
 
 
567 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.79 
 
 
570 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  46.22 
 
 
577 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  48.2 
 
 
581 aa  405  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  50.55 
 
 
567 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  48.97 
 
 
562 aa  398  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.25 
 
 
593 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  49.07 
 
 
563 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.25 
 
 
586 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.81 
 
 
582 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  47.78 
 
 
556 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.11 
 
 
565 aa  354  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.18 
 
 
562 aa  351  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.75 
 
 
786 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.86 
 
 
572 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  34.19 
 
 
533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  36.75 
 
 
889 aa  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  29.43 
 
 
554 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  34.29 
 
 
1150 aa  134  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  27.84 
 
 
502 aa  131  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  28.15 
 
 
530 aa  126  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.01 
 
 
1150 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  31.06 
 
 
538 aa  118  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.19 
 
 
1152 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  30.07 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.54 
 
 
526 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.47 
 
 
552 aa  113  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  28.04 
 
 
544 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.44 
 
 
1132 aa  112  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  26.62 
 
 
541 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  33.43 
 
 
513 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  28.28 
 
 
543 aa  106  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  25.31 
 
 
534 aa  105  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  33.23 
 
 
1152 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  27.66 
 
 
551 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  30.36 
 
 
534 aa  99.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  31.95 
 
 
547 aa  97.8  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.12 
 
 
535 aa  97.8  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.1 
 
 
515 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  29.39 
 
 
546 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.14 
 
 
556 aa  87  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  27.64 
 
 
563 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  27.45 
 
 
563 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  27.45 
 
 
563 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.36 
 
 
573 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.39 
 
 
520 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  29.97 
 
 
543 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.39 
 
 
550 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.69 
 
 
573 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  24.59 
 
 
547 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  24.78 
 
 
534 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90828  long chain fatty acid oxidase  22.08 
 
 
699 aa  75.1  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.654464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.73 
 
 
470 aa  74.3  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  21.78 
 
 
697 aa  74.3  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 
547 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.98 
 
 
518 aa  74.3  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  23.92 
 
 
745 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.56 
 
 
548 aa  72  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  26.77 
 
 
549 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.16 
 
 
522 aa  71.6  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.28 
 
 
522 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.28 
 
 
522 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  25.04 
 
 
1146 aa  68.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.87 
 
 
533 aa  67.4  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  30.43 
 
 
533 aa  67.4  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.5 
 
 
556 aa  67  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.18 
 
 
556 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.91 
 
 
527 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  24.67 
 
 
521 aa  65.1  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>