126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2873 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
500 aa  975    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  97.8 
 
 
500 aa  934    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  37.05 
 
 
448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  39.4 
 
 
471 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  39.76 
 
 
457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  35.52 
 
 
458 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3132  polysaccharide biosynthesis protein  38.46 
 
 
458 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2583  polysaccharide biosynthesis protein  37.59 
 
 
458 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2723  polysaccharide biosynthesis protein  37.41 
 
 
458 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180264  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  32.69 
 
 
465 aa  202  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  32.69 
 
 
455 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  29.06 
 
 
502 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2377  polysaccharide biosynthesis protein  30.92 
 
 
446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.992066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  27.58 
 
 
493 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 
492 aa  98.2  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  26.53 
 
 
506 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
507 aa  95.1  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 
486 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 
503 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 
500 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 
489 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 
497 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 
483 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 
493 aa  84.7  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  23.03 
 
 
487 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.71 
 
 
508 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  26.23 
 
 
501 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1083  PST family polysaccharide exporter  27.1 
 
 
467 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 
500 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  28.17 
 
 
502 aa  80.5  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 
483 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  21.88 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  24.1 
 
 
488 aa  78.2  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  26.65 
 
 
533 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  23.05 
 
 
471 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 
484 aa  78.2  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  25.77 
 
 
497 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  24.7 
 
 
510 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 
510 aa  76.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  25.66 
 
 
501 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 
493 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  20.88 
 
 
482 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  20.78 
 
 
477 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 
507 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  21.35 
 
 
479 aa  74.3  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 
501 aa  73.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 
488 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  24.51 
 
 
508 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  29.18 
 
 
575 aa  70.5  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 
475 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  27.16 
 
 
498 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02594  possible polysaccharide export protein  25.91 
 
 
493 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4129  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  23.03 
 
 
510 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  23.03 
 
 
510 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  23.16 
 
 
510 aa  67  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  23.16 
 
 
510 aa  67  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 
503 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  19.87 
 
 
479 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 
497 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  21.13 
 
 
487 aa  65.1  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 
490 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 
487 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  23.24 
 
 
503 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 
484 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  22.35 
 
 
492 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  22.35 
 
 
492 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 
492 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  22.35 
 
 
492 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  22.49 
 
 
492 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 
469 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  22.35 
 
 
492 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.49 
 
 
492 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.49 
 
 
492 aa  62.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  23.35 
 
 
508 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3847  PST family polysaccharide export protein  23.44 
 
 
437 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 
490 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  19.65 
 
 
475 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  19.65 
 
 
474 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 
491 aa  60.1  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 
480 aa  60.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  20.31 
 
 
490 aa  60.1  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 
499 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  22.22 
 
 
492 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 
515 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  26.39 
 
 
514 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 
520 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0832  polysaccharide biosynthesis protein  23.71 
 
 
432 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 
492 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  23.97 
 
 
504 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  25.66 
 
 
504 aa  58.2  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  17.18 
 
 
476 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 
504 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 
494 aa  57.4  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 
415 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  23.1 
 
 
504 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 
509 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  21.68 
 
 
508 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.24308 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>