More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2232 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2232  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  100 
 
 
341 aa  676    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00256463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2320  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  99.12 
 
 
341 aa  670    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0373166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1628  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  97.07 
 
 
341 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2183  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  79.41 
 
 
339 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3723  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  72.47 
 
 
329 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.793133  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.79 
 
 
299 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62 
 
 
300 aa  391  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2788  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.53 
 
 
308 aa  391  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1465  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.85 
 
 
308 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1702  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.7 
 
 
293 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.33 
 
 
300 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4348  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.64 
 
 
291 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.265556  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61 
 
 
300 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.33 
 
 
300 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.33 
 
 
300 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000061731  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3485  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.34 
 
 
290 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.622532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.33 
 
 
300 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000526587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.33 
 
 
300 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.33 
 
 
300 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.33 
 
 
300 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.33 
 
 
300 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.33 
 
 
300 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.33 
 
 
300 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000124479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1041  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.03 
 
 
290 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3222  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.03 
 
 
290 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0156  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.34 
 
 
290 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.852217  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0814  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.25 
 
 
302 aa  378  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0497664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3658  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61 
 
 
300 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316664  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2405  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.67 
 
 
300 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.861166  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0078  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.49 
 
 
294 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.735177 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0600  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.76 
 
 
291 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0581  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.76 
 
 
291 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1453  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.2 
 
 
291 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.33077  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0966  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  61.15 
 
 
294 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2548  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  60.82 
 
 
290 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.12229 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2626  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.15 
 
 
294 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639809  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2911  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.62 
 
 
290 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01878  Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.72 
 
 
290 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2498  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.93 
 
 
292 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2068  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  62.59 
 
 
296 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000768235  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2260  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  62.59 
 
 
291 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237246  hitchhiker  0.0000000231889 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1330  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.21 
 
 
302 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1181  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  61.95 
 
 
296 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1147  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.62 
 
 
290 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1305  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.21 
 
 
302 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0212377  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2039  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.99 
 
 
291 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1802  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.07 
 
 
290 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.155061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3097  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.93 
 
 
290 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2038  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.99 
 
 
290 aa  368  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.211193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1270  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.59 
 
 
290 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.531627  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1239  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.93 
 
 
290 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.961959  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1888  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  60.07 
 
 
292 aa  371  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0924  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.59 
 
 
291 aa  370  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000794119  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2118  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.99 
 
 
290 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0810  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.03 
 
 
288 aa  368  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1158  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.03 
 
 
290 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1229  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.58 
 
 
289 aa  368  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00688  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.97 
 
 
289 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2907  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.97 
 
 
289 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0772  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.89 
 
 
289 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0741  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.97 
 
 
289 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1387  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.97 
 
 
290 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.341558  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2965  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.97 
 
 
290 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0730  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  60.07 
 
 
291 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000463051  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0755  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.97 
 
 
289 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0798  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.89 
 
 
289 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0115  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.33 
 
 
291 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3163  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.41 
 
 
291 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.608891  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.97 
 
 
289 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0776  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.97 
 
 
289 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0895  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.89 
 
 
289 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0404555  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00677  hypothetical protein  58.97 
 
 
289 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04878  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.76 
 
 
291 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0821  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.97 
 
 
289 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2878  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.97 
 
 
290 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2927  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.97 
 
 
289 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0437  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60 
 
 
315 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.188217 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0862  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.89 
 
 
289 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0472557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0833  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  58.54 
 
 
289 aa  364  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0260305  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1989  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.86 
 
 
295 aa  364  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0106  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  58.33 
 
 
291 aa  363  2e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0598  succinyl-CoA synthetase alpha chain  58.13 
 
 
294 aa  363  2e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1556  succinate-CoA ligase (ADP-forming), alpha subunit  58.13 
 
 
294 aa  363  3e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2229  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.93 
 
 
296 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2180  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.89 
 
 
290 aa  362  6e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0619  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.45 
 
 
293 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000506874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0714  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  60.41 
 
 
291 aa  361  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000108729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3685  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.63 
 
 
295 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2499  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.29 
 
 
295 aa  360  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285546  normal  0.123009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43940  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.63 
 
 
295 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4185  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.63 
 
 
294 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0270  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  56.45 
 
 
291 aa  360  2e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3508  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.63 
 
 
294 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.214073  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3756  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.63 
 
 
294 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1669  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  57.63 
 
 
294 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.212959  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1624  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.92 
 
 
291 aa  359  4e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2796  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  57.99 
 
 
290 aa  359  5e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.623771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1715  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.96 
 
 
296 aa  358  6e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1373  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.84 
 
 
293 aa  358  7e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0250  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  58.22 
 
 
290 aa  358  9e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>