More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2102 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 
1078 aa  2101    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  92.47 
 
 
1077 aa  1090    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  84.17 
 
 
1021 aa  1692    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  64.5 
 
 
1206 aa  723    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  32.74 
 
 
956 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.6 
 
 
970 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.97 
 
 
976 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0325  WD40 domain-containing protein beta Propeller  27.41 
 
 
901 aa  229  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  24.86 
 
 
918 aa  223  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2423  WD40 domain protein beta Propeller  28.63 
 
 
881 aa  187  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1171  WD40 domain protein beta Propeller  27.82 
 
 
947 aa  127  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  25.72 
 
 
970 aa  105  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1741  hypothetical protein  23.55 
 
 
977 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0016  hypothetical protein  21.48 
 
 
979 aa  87.8  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  31.05 
 
 
1005 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.13 
 
 
422 aa  77.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  34.13 
 
 
422 aa  77.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.7 
 
 
442 aa  77.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  31.97 
 
 
442 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  32.96 
 
 
428 aa  77.4  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  36.99 
 
 
435 aa  77.4  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  32.59 
 
 
442 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  30.77 
 
 
442 aa  76.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.25 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  34.48 
 
 
451 aa  75.5  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  32.76 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  40.25 
 
 
982 aa  75.1  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  38.52 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  34.07 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  42.16 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  32.74 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  29.71 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  32.74 
 
 
442 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  32.28 
 
 
444 aa  74.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  32.28 
 
 
444 aa  74.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  32.74 
 
 
442 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.07 
 
 
446 aa  74.3  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  32.82 
 
 
426 aa  73.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  32.28 
 
 
444 aa  74.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  32.74 
 
 
442 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  33.59 
 
 
462 aa  73.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  33.33 
 
 
440 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  31.11 
 
 
442 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  33.59 
 
 
509 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  41.12 
 
 
1059 aa  73.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  35.04 
 
 
437 aa  73.2  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  35.04 
 
 
440 aa  73.2  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  35.51 
 
 
430 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  35.51 
 
 
430 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  38.89 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  31.11 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.52 
 
 
1028 aa  73.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  40.95 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  37.96 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  32.59 
 
 
450 aa  72.8  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  28.4 
 
 
442 aa  72.4  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  32.82 
 
 
450 aa  72  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.93 
 
 
428 aa  72  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  31.11 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  37.62 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  33.59 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  32.58 
 
 
450 aa  70.9  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.07 
 
 
446 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  34.78 
 
 
430 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  32.58 
 
 
441 aa  70.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  37.07 
 
 
446 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  35.11 
 
 
444 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  36.52 
 
 
424 aa  70.1  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  36.04 
 
 
445 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.48 
 
 
450 aa  70.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  37.27 
 
 
567 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  36.8 
 
 
1014 aa  69.7  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  40.2 
 
 
572 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  37.62 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  36.3 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  36.28 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  38.24 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  33.6 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  21.04 
 
 
1060 aa  68.9  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  31.86 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  31.86 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  34.01 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  31.86 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  35.4 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  38.1 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  34.75 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  42.45 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  34.45 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  37.9 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  31.87 
 
 
432 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.48 
 
 
448 aa  67.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  35.04 
 
 
446 aa  67.8  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  36.19 
 
 
431 aa  67.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  39.05 
 
 
450 aa  67.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  36.19 
 
 
431 aa  67.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  37.1 
 
 
434 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  32.94 
 
 
430 aa  66.6  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  36.19 
 
 
431 aa  67.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  34.45 
 
 
449 aa  67  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  36.19 
 
 
431 aa  67.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>