More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_2063 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  100 
 
 
419 aa  812    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  99.52 
 
 
419 aa  806    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  92.36 
 
 
419 aa  687    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  43.46 
 
 
421 aa  296  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  33.82 
 
 
391 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  32.85 
 
 
380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  34.24 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  34.4 
 
 
400 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  33.82 
 
 
400 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  28.78 
 
 
383 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  34.39 
 
 
394 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  36.34 
 
 
391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  30.1 
 
 
374 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  29.46 
 
 
374 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  29.21 
 
 
375 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  29.68 
 
 
374 aa  160  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  33.74 
 
 
385 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  29.85 
 
 
374 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  29.85 
 
 
374 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  30.71 
 
 
408 aa  158  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  27.83 
 
 
375 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  29.27 
 
 
392 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  29.68 
 
 
374 aa  156  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  29.38 
 
 
374 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  29.68 
 
 
383 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  29.43 
 
 
374 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  29.43 
 
 
374 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  29 
 
 
375 aa  154  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  32.62 
 
 
416 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  29.7 
 
 
370 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  33.58 
 
 
393 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  31.1 
 
 
376 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  28.43 
 
 
377 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  29.7 
 
 
370 aa  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  32.79 
 
 
422 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  33.66 
 
 
389 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  33.33 
 
 
393 aa  149  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  30.41 
 
 
379 aa  149  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  28.67 
 
 
374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  28.04 
 
 
374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  35.84 
 
 
429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  32.93 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  32.35 
 
 
381 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  27.7 
 
 
378 aa  147  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  33.08 
 
 
394 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  32.54 
 
 
410 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  29.44 
 
 
382 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  32.05 
 
 
390 aa  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  32.2 
 
 
414 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  32.45 
 
 
415 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  32.2 
 
 
414 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  32.93 
 
 
400 aa  142  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  33.41 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  29.41 
 
 
376 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  31.87 
 
 
427 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  32.16 
 
 
408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  32.36 
 
 
418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  31.23 
 
 
408 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  33.73 
 
 
397 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  34.21 
 
 
410 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  31.23 
 
 
408 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  31.25 
 
 
463 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  31.33 
 
 
408 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  31.33 
 
 
408 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  31.39 
 
 
408 aa  136  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  31.33 
 
 
408 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  32.94 
 
 
412 aa  136  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  32.93 
 
 
425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  34.57 
 
 
418 aa  133  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  32.53 
 
 
382 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  33.01 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  30.86 
 
 
422 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  31.49 
 
 
382 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  31.43 
 
 
382 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  33.67 
 
 
300 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  33.67 
 
 
300 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  32.84 
 
 
420 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  26.84 
 
 
334 aa  97.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  26.52 
 
 
339 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  29.88 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  33.91 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  35.83 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  35.83 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  29.79 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  28.88 
 
 
387 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  32.05 
 
 
313 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  29.28 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  30.36 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.03 
 
 
763 aa  72.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  31.22 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  32.91 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  30.04 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  30.71 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  31.87 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  29.51 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  29.51 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2219  Patatin  28.87 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  27.78 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  27.78 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  27.78 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>