More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1786 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  48.31 
 
 
1620 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.961951 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  42.26 
 
 
1538 aa  1059    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  42.26 
 
 
1538 aa  1059    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2140  DEAD/H associated domain protein  39.7 
 
 
1741 aa  981    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.800534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  50.49 
 
 
1572 aa  1260    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  46.75 
 
 
1544 aa  1197    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  99.09 
 
 
1536 aa  2912    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  35.49 
 
 
1434 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.59 
 
 
1412 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.82 
 
 
1426 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2453  DEAD/H associated domain protein  48.14 
 
 
1668 aa  849    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  41.62 
 
 
1538 aa  1059    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.44 
 
 
1523 aa  1189    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  51.08 
 
 
1549 aa  1237    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  52.53 
 
 
1606 aa  1211    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  45.07 
 
 
1729 aa  929    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.21 
 
 
1517 aa  1135    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  50.53 
 
 
1584 aa  1268    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1541  DEAD/H associated domain protein  47.36 
 
 
1694 aa  1151    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00672173  normal  0.215224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  35.57 
 
 
1431 aa  653    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  42.26 
 
 
1538 aa  1059    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  47.96 
 
 
1632 aa  1170    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.72 
 
 
1429 aa  659    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  49.61 
 
 
1480 aa  1218    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  42.44 
 
 
1618 aa  1065    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  97.4 
 
 
1536 aa  2648    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  50.44 
 
 
1567 aa  1314    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1578  DEAD/H associated domain protein  49.11 
 
 
1604 aa  1034    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.95 
 
 
1502 aa  659    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17730  ATP dependent helicase, Lhr family  50.12 
 
 
1660 aa  655    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.5543  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  37.5 
 
 
1448 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.16 
 
 
1451 aa  652    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.64 
 
 
1510 aa  657    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  52.18 
 
 
1535 aa  1317    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  43.89 
 
 
1601 aa  1079    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  46.71 
 
 
1513 aa  1121    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  59.18 
 
 
1531 aa  1713    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  36.19 
 
 
1435 aa  672    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  46.33 
 
 
1523 aa  1181    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  42.03 
 
 
1538 aa  1059    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  52.37 
 
 
1644 aa  1128    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  36.17 
 
 
1504 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  37.6 
 
 
1448 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0623  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.28 
 
 
1694 aa  1192    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.19 
 
 
1539 aa  1248    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  48.26 
 
 
1493 aa  1182    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.15 
 
 
1534 aa  830    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  44.56 
 
 
1534 aa  1104    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  100 
 
 
1536 aa  2931    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  77.3 
 
 
1553 aa  2201    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  47.12 
 
 
1506 aa  1165    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.6 
 
 
1561 aa  1239    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.29 
 
 
1516 aa  1273    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  50.6 
 
 
1509 aa  1202    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.33 
 
 
1523 aa  1181    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.27 
 
 
1514 aa  1164    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  42.26 
 
 
1525 aa  1051    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0301  Lhr-like helicase  45.53 
 
 
1577 aa  791    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.610985  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  49.52 
 
 
1523 aa  1278    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.71 
 
 
1613 aa  1275    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  42.04 
 
 
1538 aa  1057    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  42.17 
 
 
1538 aa  1059    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  47.74 
 
 
1649 aa  1150    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.49 
 
 
1476 aa  1279    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.47 
 
 
1497 aa  634  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  38.37 
 
 
1388 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.13 
 
 
1480 aa  628  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  37.54 
 
 
1573 aa  610  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  38.96 
 
 
1495 aa  581  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.16 
 
 
1381 aa  509  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.51 
 
 
1475 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  33.52 
 
 
1688 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  40.13 
 
 
1419 aa  473  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.47 
 
 
1508 aa  459  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  45.37 
 
 
1515 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.15 
 
 
1505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.73 
 
 
1518 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.5 
 
 
1598 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  44.5 
 
 
1598 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.59 
 
 
1700 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.59 
 
 
1626 aa  438  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  44.5 
 
 
1599 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.5 
 
 
1598 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.5 
 
 
1598 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  44.52 
 
 
1598 aa  440  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  34.58 
 
 
888 aa  410  1e-113  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  31.56 
 
 
875 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  32.06 
 
 
873 aa  391  1e-107  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  32.53 
 
 
870 aa  381  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  28.75 
 
 
872 aa  372  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  28.79 
 
 
874 aa  366  2e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  28.97 
 
 
874 aa  366  2e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  28.71 
 
 
874 aa  365  4e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  31.93 
 
 
872 aa  346  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  32.45 
 
 
914 aa  339  2.9999999999999997e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  31.04 
 
 
922 aa  336  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  31.12 
 
 
915 aa  333  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  34.21 
 
 
941 aa  328  7e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  29.92 
 
 
1523 aa  312  2.9999999999999997e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  30.28 
 
 
955 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>