More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1427 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
68 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
68 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
68 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  95.59 
 
 
68 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0024  helix-turn-helix domain-containing protein  88.06 
 
 
80 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720603  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  60 
 
 
68 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  58.46 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  58.46 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  58.46 
 
 
69 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  56.36 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  46.15 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  48.53 
 
 
230 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0455  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.181853  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  52.73 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  47.54 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 
74 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1228  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
81 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl067  Cro/CI family transcriptional regulator  40.68 
 
 
78 aa  52  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
81 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  45 
 
 
154 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
81 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0713  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.76 
 
 
81 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 
72 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  50.91 
 
 
72 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 
73 aa  50.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0130  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0877719  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3368  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 
78 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.101662 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
71 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
71 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0196  subunit S of type I restriction-modification system  45.16 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.525048 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1199  subunit S of type I restriction-modification system  45.16 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 
72 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 
90 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 
76 aa  50.1  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 
76 aa  50.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1485  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0684  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0300399  normal  0.200777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2753  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
424 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 
816 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 
60 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  43.86 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  40.58 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  55.56 
 
 
196 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  42.19 
 
 
87 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0668  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  39.71 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0843  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
71 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  55.1 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
500 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3812  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.497923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4003  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.168012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3515  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0455  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.846585  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 
421 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2636  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 
496 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4534  helix-turn-helix domain protein  45 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2248  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 
505 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2481  DNA-binding protein  43.33 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193646  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
333 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
333 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6378  PbsX family transcriptional regulator  43.08 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  38.33 
 
 
75 aa  47  0.00008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  41.51 
 
 
180 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.31 
 
 
80 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3325  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951431  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0999  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.98 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  39.71 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  39.71 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3590  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334421  normal  0.665085 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  39.71 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>