More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1309 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 
613 aa  1241  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1323  protein-export membrane protein SecD  75.28 
 
 
611 aa  930  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.970602  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  99.02 
 
 
613 aa  1234  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  97.88 
 
 
613 aa  1222  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  35.58 
 
 
532 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  35.37 
 
 
530 aa  340  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  34.62 
 
 
532 aa  333  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  38.65 
 
 
533 aa  329  9e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  34.35 
 
 
533 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  35.61 
 
 
532 aa  327  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  37.05 
 
 
533 aa  323  7e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  36.16 
 
 
605 aa  320  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  36.59 
 
 
594 aa  317  3e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  34.2 
 
 
595 aa  313  4e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  34.52 
 
 
533 aa  313  5e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  35.96 
 
 
622 aa  308  2e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  35.38 
 
 
619 aa  306  1e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  34.19 
 
 
607 aa  299  1e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0013  preprotein translocase subunit SecD  35.77 
 
 
624 aa  296  6e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2396  protein-export membrane protein SecD  33.59 
 
 
637 aa  296  9e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564509  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  34.24 
 
 
534 aa  293  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  33.96 
 
 
638 aa  293  8e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  33.77 
 
 
525 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  36.42 
 
 
473 aa  277  5e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  36.82 
 
 
1029 aa  274  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  31.18 
 
 
522 aa  273  7e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  33.97 
 
 
524 aa  271  3e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  3.11445e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  35.22 
 
 
618 aa  271  3e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  48.79 
 
 
533 aa  270  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.56259e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.79 
 
 
995 aa  270  7e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  32.29 
 
 
512 aa  270  7e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  42.93 
 
 
594 aa  266  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  42.93 
 
 
594 aa  266  1e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  32.91 
 
 
521 aa  263  5e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  50.72 
 
 
532 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  33.17 
 
 
532 aa  263  7e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  49.12 
 
 
531 aa  263  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  52.13 
 
 
530 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  33.21 
 
 
521 aa  261  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.56 
 
 
991 aa  254  4e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3095  preprotein translocase subunit SecD  33.28 
 
 
604 aa  250  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  32.74 
 
 
616 aa  249  9e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  39.15 
 
 
533 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  37.33 
 
 
470 aa  248  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004365  protein-export membrane protein SecD  33.75 
 
 
607 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  47.55 
 
 
843 aa  248  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  45.88 
 
 
530 aa  248  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  31.44 
 
 
554 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01048  preprotein translocase subunit SecD  33.75 
 
 
607 aa  247  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  40.31 
 
 
457 aa  247  4e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1236  preprotein translocase subunit SecD  31.87 
 
 
526 aa  245  1e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.543695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1230  preprotein translocase subunit SecD  32.51 
 
 
622 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.888537 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  31.38 
 
 
529 aa  244  4e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1111  preprotein translocase subunit SecD  31.7 
 
 
526 aa  243  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.789718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  46.85 
 
 
534 aa  244  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  37.96 
 
 
471 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  47.2 
 
 
533 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  44.57 
 
 
403 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.64404e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  45.24 
 
 
554 aa  241  3e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  32.05 
 
 
551 aa  241  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  44.76 
 
 
533 aa  240  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  36.36 
 
 
474 aa  239  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.33 
 
 
849 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05361  preprotein translocase subunit SecD  31.47 
 
 
612 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  30.19 
 
 
554 aa  239  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  36.7 
 
 
464 aa  239  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  46.85 
 
 
535 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.52 
 
 
981 aa  238  3e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1415  protein-export membrane protein SecD  31.86 
 
 
622 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.11 
 
 
1055 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  44.76 
 
 
533 aa  237  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  46.86 
 
 
623 aa  237  5e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  44.29 
 
 
554 aa  237  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  42.91 
 
 
526 aa  237  6e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  44.29 
 
 
554 aa  237  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  44.48 
 
 
614 aa  236  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.54 
 
 
848 aa  236  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.33 
 
 
856 aa  235  1e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  46.74 
 
 
533 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  47.2 
 
 
533 aa  234  5e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.21 
 
 
853 aa  234  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  49.28 
 
 
526 aa  233  8e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.8 
 
 
839 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  34.47 
 
 
620 aa  232  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.48 
 
 
995 aa  232  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  43.23 
 
 
625 aa  231  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  31.44 
 
 
554 aa  231  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  45.07 
 
 
556 aa  231  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1240  protein translocase subunit  43.65 
 
 
622 aa  231  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00253338  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1291  protein-export membrane protein SecD  43.65 
 
 
622 aa  229  8e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.35694e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  44.83 
 
 
622 aa  229  8e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  42.71 
 
 
510 aa  229  1e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  44.04 
 
 
406 aa  229  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  36.69 
 
 
464 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  35.24 
 
 
515 aa  228  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  44.17 
 
 
526 aa  228  4e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1122  preprotein translocase subunit SecD  46.69 
 
 
615 aa  228  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276034  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  42.62 
 
 
531 aa  226  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0865  preprotein translocase subunit SecD  31.73 
 
 
620 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0679979  normal  0.748339 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  33.7 
 
 
472 aa  226  9e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>