27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0070 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0070  Rhomboid family protein  100 
 
 
246 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.645934  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0082  Rhomboid family protein  99.59 
 
 
246 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0064  rhomboid-like protein  97.97 
 
 
246 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646008  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0066  rhomboid family protein  50.41 
 
 
244 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167584  normal  0.0382417 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1913  hypothetical protein  26.56 
 
 
265 aa  55.8  6e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  3.12193e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  23.43 
 
 
283 aa  55.5  7e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  23.81 
 
 
264 aa  51.6  1e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1426  hypothetical protein  28.11 
 
 
276 aa  50.4  3e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  24.09 
 
 
273 aa  50.1  4e-05  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0617  hypothetical protein  31.4 
 
 
273 aa  48.9  7e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08350  hypothetical protein  25.11 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  22.6 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  22.6 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  30.57 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  24.66 
 
 
220 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  24.79 
 
 
228 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  31.39 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  22.63 
 
 
273 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  28.57 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0139  hypothetical protein  27.84 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  27.66 
 
 
296 aa  45.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  24.82 
 
 
276 aa  45.4  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  23.97 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  22.71 
 
 
285 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2901  hypothetical protein  22.22 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.20399e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  26.4 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3042  hypothetical protein  30.08 
 
 
273 aa  42  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.44784e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>