More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0061 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0073  pseudouridine synthase, RluA family  99.12 
 
 
339 aa  673  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0061  pseudouridine synthase, RluA family  100 
 
 
339 aa  676  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0056  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  96.46 
 
 
339 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0059  RluA family pseudouridine synthase  80.7 
 
 
339 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.14313 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5281  RluA family pseudouridine synthase  40.88 
 
 
362 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0773013  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1379  pseudouridine synthase, RluA family  41.88 
 
 
370 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1174  RluA family pseudouridine synthase  41.05 
 
 
399 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539633  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1721  pseudouridine synthase, RluD  41.9 
 
 
346 aa  203  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  41.94 
 
 
316 aa  202  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2642  pseudouridine synthase, RluA family  41.3 
 
 
339 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704369  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2439  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  39.17 
 
 
338 aa  201  1e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122309  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4787  RluA family pseudouridine synthase  38.7 
 
 
334 aa  199  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0657  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  41.05 
 
 
320 aa  196  4e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3659  pseudouridine synthase, RluD  38.63 
 
 
378 aa  196  5e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1802  RluA family pseudouridine synthase  38.46 
 
 
304 aa  192  8e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1840  RluA family pseudouridine synthase  37.82 
 
 
304 aa  190  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3085  RluA family pseudouridine synthase  38.37 
 
 
398 aa  189  6e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1065  pseudouridine synthase, RluD  38.82 
 
 
328 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.901288  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2435  pseudouridine synthase, RluA family  39.74 
 
 
319 aa  183  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.267395  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2677  pseudouridine synthase, RluA family  40.51 
 
 
324 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.304816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1241  RluA family pseudouridine synthase  40.99 
 
 
325 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2921  pseudouridine synthase, RluA family  35.08 
 
 
341 aa  179  6e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  9.00564e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  37.25 
 
 
334 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0591  RluA family pseudouridine synthase  37.81 
 
 
322 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0464018 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0906  pseudouridine synthase, RluA family  36.74 
 
 
344 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447686  normal  0.0333397 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2175  pseudouridylate synthase  36.88 
 
 
330 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2274  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  36.58 
 
 
352 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0971  pseudouridine synthase, RluA family  36.42 
 
 
344 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.158596 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01518  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  38.39 
 
 
313 aa  176  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2087  RluA family pseudouridine synthase  36.88 
 
 
330 aa  175  1e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0919  RluA family pseudouridine synthase  35.96 
 
 
293 aa  174  2e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.976861  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0819  RluA family pseudouridine synthase  35.07 
 
 
353 aa  174  3e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0956515  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2219  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  39.5 
 
 
317 aa  173  4e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.654666  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1429  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  39.25 
 
 
327 aa  173  4e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.550632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1041  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C protein  36.14 
 
 
331 aa  173  4e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.017285  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1873  pseudouridine synthase, RluA family  39.5 
 
 
317 aa  173  4e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0755786  normal  0.858498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1063  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.08 
 
 
323 aa  172  7e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0781222  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0704  pseudouridine synthase, RluD  35.13 
 
 
312 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1563  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  37.46 
 
 
322 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.151804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1962  RluA family pseudouridine synthase  36.49 
 
 
320 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.34652e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0824  RluA family pseudouridine synthase  33.33 
 
 
317 aa  169  5e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1616  pseudouridine synthase, RluA family  37.9 
 
 
320 aa  169  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.33866e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0992  RluA family pseudouridine synthase  34.98 
 
 
316 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1322  pseudouridine synthase, RluD  36.66 
 
 
326 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000381101  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0988  RluA family pseudouridine synthase  34.98 
 
 
334 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2815  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.94 
 
 
318 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  4.64709e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4224  pseudouridine synthase, RluD  36.14 
 
 
334 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613812  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1580  pseudouridine synthase, RluA family  37.38 
 
 
319 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000241554  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1112  RluA family pseudouridine synthase  34.98 
 
 
334 aa  166  7e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594641  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0632  pseudouridine synthase, RluD  34.98 
 
 
334 aa  166  7e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00978655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1070  RluA family pseudouridine synthase  34.98 
 
 
316 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0527141  normal  0.0360601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2510  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.94 
 
 
318 aa  165  8e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  5.92786e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  30.84 
 
 
305 aa  165  1e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2192  RluA family pseudouridine synthase  35.91 
 
 
316 aa  164  1e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677227  normal  0.0743981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1614  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.08 
 
 
315 aa  164  1e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.09224e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1757  pseudouridine synthase, RluA family  36.45 
 
 
346 aa  164  2e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0151064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2515  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.45 
 
 
319 aa  162  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  4.44551e-07  hitchhiker  9.16413e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2041  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.45 
 
 
319 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  7.73418e-10  hitchhiker  0.000351853 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1208  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.45 
 
 
319 aa  162  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.1451e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2561  pseudouridine synthase, RluA family  36.45 
 
 
319 aa  162  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.99668e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1208  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.45 
 
 
319 aa  162  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.72174e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01090  hypothetical protein  36.45 
 
 
319 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  5.57514e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01082  23S rRNA pseudouridylate synthase  36.45 
 
 
319 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  7.78536e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1464  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.45 
 
 
319 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.20754e-06  hitchhiker  1.72116e-09 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1777  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.83 
 
 
328 aa  162  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00553261  decreased coverage  0.000101871 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0714  23S rRNA pseudouridylate synthase C  35.76 
 
 
326 aa  162  7e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1708  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.31 
 
 
477 aa  162  8e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2490  RluA family pseudouridine synthase  35 
 
 
335 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  1.51813e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1813  RluA family pseudouridine synthase  35 
 
 
335 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0797823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0521  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35 
 
 
335 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107606  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02917  rRNA ribosomal pseudouridine synthase  34.52 
 
 
339 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2917  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35 
 
 
477 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00370322  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2234  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C (rRNA uridine isomerase C) (rRNA pseudouridylate synthase C)  34.08 
 
 
315 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0928032  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2862  RluA family pseudouridine synthase  35 
 
 
335 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0569131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2792  RluA family pseudouridine synthase  35 
 
 
335 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000449267  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2404  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.49 
 
 
329 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.51583e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1482  RluA family pseudouridine synthase  35.87 
 
 
333 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286389  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1517  RluA family pseudouridine synthase  36.39 
 
 
333 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  1.47946e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2566  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.49 
 
 
329 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00643292  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2801  RluA family pseudouridine synthase  35 
 
 
335 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000617612  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2185  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.25 
 
 
319 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.012302  hitchhiker  1.36846e-10 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1299  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.25 
 
 
319 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.547954  hitchhiker  1.78257e-07 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1255  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.25 
 
 
319 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0242253  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2474  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.49 
 
 
329 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0799284  normal  0.0195489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1899  23S rRNA pseudouridylate synthase C  37.82 
 
 
320 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  5.84108e-09  hitchhiker  5.01686e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1284  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.25 
 
 
319 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0174547  hitchhiker  2.20374e-09 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3808  RluA family pseudouridine synthase  36.08 
 
 
333 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0127606  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002989  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.54 
 
 
314 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2239  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.14 
 
 
319 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.98156e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2303  RluA family pseudouridine synthase  33.33 
 
 
323 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1601  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.08 
 
 
315 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000249423  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2001  23S rRNA pseudouridylate synthase C  36.25 
 
 
319 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  2.44921e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2789  RluA family pseudouridine synthase  31.37 
 
 
346 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1620  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  35.26 
 
 
332 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00181118  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2290  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.29 
 
 
360 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.42 
 
 
300 aa  159  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  4.47138e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  34.74 
 
 
302 aa  159  6e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1574  RluA family pseudouridine synthase  34.18 
 
 
330 aa  159  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00553384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.71 
 
 
303 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0310  RluA family pseudouridine synthase  33.44 
 
 
303 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>