More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0047 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  95.23 
 
 
492 aa  788    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 
482 aa  898    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  96.3 
 
 
487 aa  801    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1025  GntR family transcriptional regulator  55.76 
 
 
499 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.684124 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  45.65 
 
 
478 aa  362  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.98 
 
 
494 aa  361  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
470 aa  342  5.999999999999999e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  45.66 
 
 
480 aa  342  8e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  48.03 
 
 
470 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  48.24 
 
 
470 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1191  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.49 
 
 
489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419241  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0559  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.02 
 
 
508 aa  332  9e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7471  GntR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
449 aa  332  9e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
521 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.88 
 
 
472 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2642  GntR family transcriptional regulator  41.14 
 
 
496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2148  GntR family transcriptional regulator  41.14 
 
 
498 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.61 
 
 
493 aa  309  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2235  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.6 
 
 
473 aa  307  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3547  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.57 
 
 
477 aa  307  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224357  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4437  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 
469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3187  transcriptional regulator  40.39 
 
 
487 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.685376  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4623  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.4 
 
 
489 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609617  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2912  transcriptional regulator, GntR family  33.54 
 
 
485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.784119  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  33.77 
 
 
484 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
503 aa  257  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2755  putative transcriptional regulator, GntR family  35.53 
 
 
456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.243959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
494 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
494 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 
475 aa  249  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  37.83 
 
 
494 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
494 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  36.84 
 
 
509 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
494 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.18 
 
 
488 aa  242  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  39.63 
 
 
496 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.47 
 
 
488 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  37.5 
 
 
495 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  38.46 
 
 
493 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
477 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  31.16 
 
 
477 aa  236  8e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
477 aa  236  8e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  31.16 
 
 
477 aa  236  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.74 
 
 
477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  38.46 
 
 
570 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  37.47 
 
 
509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
509 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  30.23 
 
 
480 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  38.46 
 
 
493 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.48 
 
 
483 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 
509 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
477 aa  233  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  36.68 
 
 
508 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.27 
 
 
480 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  42.8 
 
 
488 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
480 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
480 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.06 
 
 
480 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
574 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 
480 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
480 aa  229  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
480 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
480 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.32 
 
 
477 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
480 aa  229  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  35.79 
 
 
520 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
490 aa  227  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.11 
 
 
477 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4822  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
496 aa  227  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364543  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
504 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
547 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.78 
 
 
485 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.32 
 
 
496 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
503 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
490 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.51 
 
 
472 aa  223  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  43.07 
 
 
491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.79 
 
 
471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  30.53 
 
 
477 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.46 
 
 
495 aa  220  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 
520 aa  220  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  34.58 
 
 
489 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.71 
 
 
485 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.86 
 
 
470 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 
475 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
496 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
488 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.17 
 
 
490 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 
475 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.54 
 
 
498 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  35.04 
 
 
509 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2167  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  27.48 
 
 
480 aa  213  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  37.47 
 
 
496 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 
507 aa  212  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 
480 aa  212  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
476 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>