93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0035 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0035  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 
407 aa  824  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0032  membrane protein  92.38 
 
 
407 aa  750  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0047  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  99.75 
 
 
407 aa  822  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0033  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  57.07 
 
 
415 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.744264  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3521  long-chain fatty acid transport protein, outer membrane protein  25.73 
 
 
407 aa  129  1e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0470  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.88 
 
 
401 aa  111  2e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04350  outer membrane protein P1, putative  24.94 
 
 
415 aa  110  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0256286  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1410  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.37 
 
 
406 aa  96.7  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.343268  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0246  membrane protein  25.67 
 
 
435 aa  94.7  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1588  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.94 
 
 
422 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.27474e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1252  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.87 
 
 
446 aa  89  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000958296  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.81 
 
 
430 aa  89.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3234  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.14 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3370  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.25 
 
 
458 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2013  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  24.23 
 
 
432 aa  85.9  1e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1551  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.59 
 
 
400 aa  84  4e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0286516  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1800  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.65 
 
 
424 aa  82  2e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.839799  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0068  aromatic hydrocarbon degradation protein  23.11 
 
 
417 aa  80.5  5e-14  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.952244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0891  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.85 
 
 
453 aa  80.1  6e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00668397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0065  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.06 
 
 
428 aa  80.1  7e-14  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.709413 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1669  membrane protein  23.08 
 
 
427 aa  79.7  9e-14  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0135  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.22 
 
 
405 aa  78.2  2e-13  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.39 
 
 
450 aa  77.8  3e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1772  outer membrane protein transport protein (ompp1/fadl/todx)  22.75 
 
 
413 aa  76.6  7e-13  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  6.72167e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0134  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.3 
 
 
471 aa  75.9  1e-12  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3082  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.47 
 
 
416 aa  75.9  1e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  1.23053e-05  unclonable  1.31367e-05 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  21.87 
 
 
423 aa  74.7  3e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1548  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.22 
 
 
442 aa  74.3  4e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  3.3121e-15  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1585  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.24 
 
 
404 aa  72.8  9e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  20.33 
 
 
429 aa  71.6  2e-11  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5070  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.24 
 
 
437 aa  72  2e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0344553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0035  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.58 
 
 
459 aa  71.6  2e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05747  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2174  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.48 
 
 
410 aa  71.6  3e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2708  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.82 
 
 
413 aa  71.2  3e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1488  outer membrane protein transport protein (OMPP1/FadL/TodX)  24.5 
 
 
415 aa  69.7  8e-11  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  2.2561e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2044  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.57 
 
 
419 aa  69.7  9e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00212006  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0104  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.78 
 
 
439 aa  69.3  1e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2706  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.48 
 
 
400 aa  67.8  4e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0539  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.95 
 
 
488 aa  67.4  5e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.61 
 
 
424 aa  67  6e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1993  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.37 
 
 
412 aa  65.1  2e-09  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131408  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0339  OMPP1/FadL/TodX family outer membrane protein  24 
 
 
409 aa  64.3  4e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.746595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.68 
 
 
364 aa  63.9  5e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0328  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.19 
 
 
447 aa  63.2  7e-09  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3896  hypothetical protein  26.35 
 
 
442 aa  61.6  3e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2250  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.29 
 
 
407 aa  61.2  3e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2596  long chain fatty acid transport protein  23.43 
 
 
405 aa  61.2  4e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0488563  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.92 
 
 
442 aa  60.8  5e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.34 
 
 
421 aa  60.1  8e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3092  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.15 
 
 
450 aa  58.2  2e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148936 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1710  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.19 
 
 
430 aa  58.2  2e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.73 
 
 
427 aa  58.2  3e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002851  long-chain fatty acid transport protein  21.74 
 
 
442 aa  57.8  4e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  21.45 
 
 
421 aa  57.4  4e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2482  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.25 
 
 
423 aa  57.8  4e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4441  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.87 
 
 
437 aa  57  5e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  22.76 
 
 
424 aa  56.6  7e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.25 
 
 
421 aa  56.2  1e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5803  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.62 
 
 
432 aa  56.2  1e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2562  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.22 
 
 
429 aa  56.2  1e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  9.28224e-08  hitchhiker  1.30731e-10 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4102  outer membrane protein  21.16 
 
 
429 aa  55.1  2e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1834  hypothetical protein  21.78 
 
 
413 aa  54.3  4e-06  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0420265  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5229  outer membrane protein  22.72 
 
 
482 aa  53.9  5e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3997  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.18 
 
 
410 aa  53.9  5e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0634877  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  22.32 
 
 
429 aa  53.9  5e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3839  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.47 
 
 
430 aa  53.5  6e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  6.32854e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03551  outer membrane protein  21 
 
 
446 aa  53.1  8e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4030  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.11 
 
 
426 aa  53.1  8e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150189  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3004  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.25 
 
 
450 aa  53.1  9e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2203  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.69 
 
 
422 aa  53.1  9e-06  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.92236  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1804  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.62 
 
 
426 aa  52.8  1e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  0.581648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  20.79 
 
 
424 aa  52.8  1e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.638983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3793  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.96 
 
 
436 aa  52  2e-05  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4038  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.24 
 
 
410 aa  51.2  3e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.813812  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60730  putative outer membrane protein  22.61 
 
 
463 aa  51.6  3e-05  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0698  long-chain fatty acid transport protein  21.67 
 
 
419 aa  51.2  3e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0560  long-chain fatty acid transport protein  21.08 
 
 
432 aa  49.7  9e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00871251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  21.16 
 
 
422 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  19.34 
 
 
450 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.918562  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3994  long-chain fatty acid ABC transporter  24.1 
 
 
371 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0350  aromatic hydrocarbon degradation protein  21.75 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  8.05243e-08 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4491  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.1 
 
 
441 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0289  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.42 
 
 
401 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.233106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4009  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.51 
 
 
441 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4378  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.51 
 
 
441 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0500  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.28 
 
 
420 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6026  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.3 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0306  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.81 
 
 
449 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126384 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0390  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.28 
 
 
449 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0389  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.28 
 
 
449 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0415  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.28 
 
 
449 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69798e-10 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.06 
 
 
449 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000690815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3814  aromatic hydrocarbon degradation protein  23.65 
 
 
464 aa  43.1  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0090168  normal  0.0676668 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>