97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0017 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0017  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
134 aa  267  3e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  46.25 
 
 
93 aa  62.4  2e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 
92 aa  55.5  3e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  39.24 
 
 
95 aa  55.1  3e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  34.83 
 
 
91 aa  51.6  4e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  42.42 
 
 
258 aa  50.4  8e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 
83 aa  48.9  2e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 
105 aa  49.3  2e-05  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  47.17 
 
 
119 aa  48.5  3e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 
94 aa  47.8  6e-05  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 
76 aa  47.4  7e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  39.34 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  39.29 
 
 
90 aa  45.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
205 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  39.66 
 
 
181 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.23 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.73627e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  39.66 
 
 
181 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  39.66 
 
 
181 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 
201 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  39.66 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  39.66 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
181 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.4317e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  40.66 
 
 
209 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  39.66 
 
 
181 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 
184 aa  44.3  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  9.95235e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.13321e-07  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
181 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 
199 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  39.66 
 
 
181 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
189 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1826  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  40 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1393  transcriptional regulator, XRE family  46.34 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  34.91 
 
 
208 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  32.91 
 
 
201 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  44.9 
 
 
259 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 
197 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3484  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0049  XRE family transcriptional regulator  54.05 
 
 
220 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20520  DNA binding protein, XRE family  41.94 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  42.67 
 
 
203 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  40 
 
 
209 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  48.84 
 
 
57 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0285  XRE family transcriptional regulator  51.22 
 
 
74 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.17528  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 
188 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2441  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 
113 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  42.59 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  5.3147e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4808  hypothetical protein  43.86 
 
 
223 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463187 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 
300 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  3.32957e-11  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  30.67 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  30.85 
 
 
208 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  31.75 
 
 
215 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5148  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 
287 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 
214 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  2.98649e-08 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  33.85 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.04987e-09 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00560  Helix-turn-helix protein  34.33 
 
 
456 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0685  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4684  hypothetical protein  41.51 
 
 
224 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0107  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 
491 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  44.23 
 
 
180 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1419  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 
178 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2893  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
70 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0147391  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 
90 aa  40.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0063  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  45.45 
 
 
255 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.93278e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  1.14e-14 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  30.77 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 
256 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.31765e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 
185 aa  40.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  31.87 
 
 
186 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  4.46905e-09 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 
103 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5197  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 
88 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2271  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 
141 aa  40  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.571583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>