More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4375 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4375  histidine kinase  100 
 
 
246 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821141  decreased coverage  0.0094806 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4358  histidine kinase  64.32 
 
 
245 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00933399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4381  histidine kinase  63.85 
 
 
245 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.030036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4225  histidine kinase  63.38 
 
 
245 aa  243  2e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  39.47 
 
 
626 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  36.82 
 
 
621 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
839 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  38.95 
 
 
621 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  30.32 
 
 
410 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3526  histidine kinase  47.47 
 
 
458 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
567 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  31.88 
 
 
517 aa  89.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  37.74 
 
 
634 aa  89  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4673  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
713 aa  88.6  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
652 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
933 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  3.19453e-05 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
494 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
588 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
492 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  36.84 
 
 
630 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  38.39 
 
 
645 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
607 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
707 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  28.57 
 
 
592 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
695 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3588  two-component sensor kinase CbrA  35.71 
 
 
984 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.883039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
987 aa  85.9  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  37.44 
 
 
659 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
592 aa  85.5  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4771  histidine kinase  35.32 
 
 
624 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.415438 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
520 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.85 
 
 
679 aa  84.3  1e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1360  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
403 aa  84.3  1e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  35.68 
 
 
627 aa  84.7  1e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
630 aa  84.7  1e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
408 aa  84.7  1e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1510  C4-dicarboxylate transport sensor protein dctB  31.9 
 
 
322 aa  84.7  1e-15  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.220294  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1230  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  31.9 
 
 
310 aa  84.7  1e-15  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0439907  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
634 aa  83.6  2e-15  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  33.49 
 
 
666 aa  84  2e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
634 aa  83.6  2e-15  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 
801 aa  84  2e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
523 aa  83.6  2e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
544 aa  84.3  2e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
523 aa  84  2e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  37.5 
 
 
982 aa  84  2e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  34.98 
 
 
635 aa  84  2e-15  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
680 aa  84.3  2e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  31.42 
 
 
655 aa  84  2e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  31.9 
 
 
643 aa  83.6  2e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
516 aa  83.2  3e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2548  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
861 aa  83.2  3e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  31.9 
 
 
643 aa  83.6  3e-15  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.86 
 
 
404 aa  83.6  3e-15  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  31.9 
 
 
643 aa  83.6  3e-15  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  3.97989e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4577  cyclic nucleotide-binding protein  33.12 
 
 
463 aa  83.6  3e-15  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.861661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0595  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
473 aa  83.6  3e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0878  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
760 aa  82.8  4e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.808443 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
491 aa  83.2  4e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
498 aa  82.8  4e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4695  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
991 aa  82.8  4e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  9.69954e-06 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  34.6 
 
 
983 aa  82.4  5e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
635 aa  82.8  5e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  34.48 
 
 
615 aa  82.8  5e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0832  PAS  35.58 
 
 
984 aa  82.4  5e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
441 aa  82.8  5e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
991 aa  82.4  6e-15  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  hitchhiker  7.34254e-05 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 
441 aa  82.4  6e-15  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
921 aa  82.4  7e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1340  sporulation kinase  25.45 
 
 
420 aa  82  7e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
495 aa  82  8e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
991 aa  82  8e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  6.30671e-05 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  32.51 
 
 
450 aa  82  8e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
514 aa  82  8e-15  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1339  sensor histidine kinase, C-terminal region; sporulation kinase  25.45 
 
 
420 aa  82  8e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3380  hypothetical protein  47.52 
 
 
439 aa  82  9e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0246  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
573 aa  81.6  9e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
627 aa  81.6  1e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2370  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
672 aa  81.6  1e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 
1186 aa  81.3  1e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
683 aa  81.3  1e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
701 aa  81.3  1e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  5.62313e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  34.6 
 
 
983 aa  81.3  1e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2440  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
375 aa  81.3  1e-14  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.627522 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
551 aa  81.3  1e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
630 aa  80.9  2e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.941233  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0672  histidine kinase  39.41 
 
 
373 aa  80.9  2e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0965  sensor histidine kinase  36.06 
 
 
982 aa  80.9  2e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2176  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
551 aa  80.5  2e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
468 aa  80.5  2e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  30 
 
 
516 aa  80.9  2e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  29.46 
 
 
863 aa  80.9  2e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0738  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
991 aa  80.9  2e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  3.40339e-08 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.68 
 
 
1255 aa  80.1  3e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
512 aa  80.1  3e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  33.33 
 
 
600 aa  80.1  3e-14  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  32.5 
 
 
623 aa  80.1  3e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
734 aa  80.1  3e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
492 aa  80.1  3e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
654 aa  80.1  3e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>