More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4139 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4139  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 
248 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000428819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0431  exodeoxyribonuclease III  80.65 
 
 
262 aa  404  1e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0459  exodeoxyribonuclease III Xth  80.65 
 
 
265 aa  400  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0460  exodeoxyribonuclease III Xth  80.65 
 
 
264 aa  399  1e-110  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0146  exodeoxyribonuclease III Xth  41.67 
 
 
258 aa  214  1e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00325986  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2513  exodeoxyribonuclease III Xth  44.27 
 
 
256 aa  214  1e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120216  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0157  exodeoxyribonuclease III Xth  40.16 
 
 
258 aa  203  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00989742  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0113  AP endonuclease  40.08 
 
 
267 aa  201  1e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0161  exodeoxyribonuclease III Xth  37.7 
 
 
256 aa  182  4e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.011362  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  36.72 
 
 
260 aa  158  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  34.92 
 
 
270 aa  152  3e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  37.21 
 
 
258 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  37.21 
 
 
258 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  37.69 
 
 
277 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09930  putative exonuclease III  38.89 
 
 
266 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0994533  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0921  exodeoxyribonuclease III  38.89 
 
 
261 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  37.11 
 
 
258 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3424  exodeoxyribonuclease III  36.74 
 
 
272 aa  147  1e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.903718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  36.96 
 
 
265 aa  147  1e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  38.91 
 
 
260 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2707  exodeoxyribonuclease III, putative  36.96 
 
 
265 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4299  exodeoxyribonuclease III Xth  35.71 
 
 
257 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231101  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  35.66 
 
 
258 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  35.6 
 
 
258 aa  145  7e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  36.72 
 
 
269 aa  145  7e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  35.77 
 
 
258 aa  145  7e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  34.98 
 
 
282 aa  145  8e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  33.08 
 
 
279 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3010  exodeoxyribonuclease III Xth  36.19 
 
 
265 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5537  exodeoxyribonuclease III Xth  36.82 
 
 
308 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  32.7 
 
 
262 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  37.11 
 
 
271 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  32.7 
 
 
262 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  37.11 
 
 
271 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  35.32 
 
 
264 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  35.77 
 
 
258 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  35.38 
 
 
258 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  35.27 
 
 
258 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  35.27 
 
 
258 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  35.27 
 
 
258 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  35.77 
 
 
258 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  35.27 
 
 
258 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  35.27 
 
 
258 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  35.27 
 
 
322 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  35.27 
 
 
258 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1386  exodeoxyribonuclease III Xth  36.19 
 
 
263 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.031293  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  36.72 
 
 
259 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  36.61 
 
 
257 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  36.19 
 
 
260 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3456  exodeoxyribonuclease III Xth  35.02 
 
 
303 aa  141  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2061  exodeoxyribonuclease III (exonuclease III)  35.04 
 
 
255 aa  141  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240867  normal  0.343531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  32.95 
 
 
260 aa  141  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  37.89 
 
 
254 aa  140  1e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1491  exodeoxyribonuclease III Xth  36.58 
 
 
264 aa  141  1e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  33.07 
 
 
257 aa  140  2e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  32.82 
 
 
261 aa  140  2e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0579  exodeoxyribonuclease III (xth)  34 
 
 
274 aa  140  2e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0877  exodeoxyribonuclease III Xth  32.94 
 
 
264 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278743 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1964  exodeoxyribonuclease III Xth  34.39 
 
 
258 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0747161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  35.94 
 
 
272 aa  139  4e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3728  exodeoxyribonuclease III Xth  35.46 
 
 
256 aa  139  5e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2221  exodeoxyribonuclease III  35.41 
 
 
270 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162729  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0065  exodeoxyribonuclease III Xth  37.8 
 
 
259 aa  137  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  36.43 
 
 
267 aa  137  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  29.28 
 
 
281 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  35.52 
 
 
254 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2898  exodeoxyribonuclease III  34.52 
 
 
284 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696489  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  35.42 
 
 
269 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  35.66 
 
 
255 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  2.98085e-05 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3799  exodeoxyribonuclease III  34.26 
 
 
256 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3911  exodeoxyribonuclease III  36.76 
 
 
271 aa  136  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  29.66 
 
 
281 aa  136  3e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4910  exodeoxyribonuclease III  35.02 
 
 
283 aa  136  3e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.38033  decreased coverage  0.000445359 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  28.52 
 
 
281 aa  136  3e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  35.18 
 
 
253 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.92 
 
 
258 aa  135  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.68 
 
 
256 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  35.18 
 
 
255 aa  136  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  33.46 
 
 
259 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  35.6 
 
 
258 aa  135  6e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  38.31 
 
 
262 aa  135  6e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  35.55 
 
 
255 aa  135  6e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  32.7 
 
 
288 aa  135  6e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  31.06 
 
 
277 aa  135  7e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  29.66 
 
 
281 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  35.41 
 
 
270 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0446  exodeoxyribonuclease III Xth  37.11 
 
 
258 aa  135  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  35.25 
 
 
257 aa  135  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  36.33 
 
 
269 aa  134  1e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  34.69 
 
 
269 aa  134  1e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3423  exodeoxyribonuclease III  37.25 
 
 
255 aa  134  1e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3068  exodeoxyribonuclease III Xth  36.68 
 
 
255 aa  133  2e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.504533 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  35.69 
 
 
255 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  34.09 
 
 
260 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  32.14 
 
 
261 aa  132  4e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  33.72 
 
 
256 aa  132  4e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  33.59 
 
 
265 aa  132  4e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  30.49 
 
 
251 aa  132  4e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0836  exonuclease III  31.2 
 
 
267 aa  132  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.337185  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0461  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.07 
 
 
267 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>