More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4081 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  100 
 
 		 571 aa  1130    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  22.05 
 
 		 525 aa  117  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0543  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  21.32 
 
 		 526 aa  108  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116233  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  24.87 
 
 		 518 aa  107  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  26.39 
 
 		 518 aa  107  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  26.99 
 
 		 508 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  25.93 
 
 		 520 aa  103  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  24.38 
 
 		 506 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 506 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 503 aa  100  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  23.58 
 
 		 500 aa  97.4  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  25.89 
 
 		 504 aa  96.3  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  23.92 
 
 		 512 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  22.87 
 
 		 532 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  23.92 
 
 		 512 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  28.06 
 
 		 509 aa  91.3  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  27.42 
 
 		 507 aa  89  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  21.44 
 
 		 509 aa  87.4  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  21.18 
 
 		 509 aa  87  8e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  25 
 
 		 508 aa  86.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  21.99 
 
 		 938 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  25.36 
 
 		 708 aa  84.7  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.16 
 
 		 740 aa  84.7  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  26.22 
 
 		 501 aa  84.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  23.44 
 
 		 523 aa  83.2  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 547 aa  80.9  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.26 
 
 		 542 aa  79  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1174  All-trans-retinol 13,14-reductase  22.15 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  20.65 
 
 		 509 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  29.18 
 
 		 503 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  21.13 
 
 		 535 aa  76.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  24.9 
 
 		 717 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  20.22 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  31.21 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  22.45 
 
 		 500 aa  73.9  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  25.04 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  26.33 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  23.66 
 
 		 502 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 534 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  24.13 
 
 		 598 aa  72.8  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  24.05 
 
 		 514 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  23.09 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  26.51 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  23.84 
 
 		 711 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.22 
 
 		 544 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  26.16 
 
 		 504 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3281  FAD dependent oxidoreductase  24.12 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463065  normal  0.0612809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  25 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  22.88 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  24.94 
 
 		 497 aa  70.5  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  22.01 
 
 		 504 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 		 722 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2032  FAD dependent oxidoreductase  22.54 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.756687 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0436  All-trans-retinol 13,14-reductase  20.33 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.601478 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  22.68 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  25.18 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  22.3 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0425  All-trans-retinol 13,14-reductase  20.33 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.06 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  21.75 
 
 		 514 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  26.15 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  22.98 
 
 		 516 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2002  FAD dependent oxidoreductase  20.45 
 
 		 510 aa  67  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  24.63 
 
 		 501 aa  67  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  29.85 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  20.45 
 
 		 493 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  24.19 
 
 		 553 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 530 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 530 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  21.68 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  22.28 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  26.49 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  29.23 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 560 aa  64.3  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  45.45 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  25.59 
 
 		 519 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  23.15 
 
 		 547 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 530 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  52.83 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  25.73 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  26.25 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  24.65 
 
 		 595 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 528 aa  62  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  26.73 
 
 		 554 aa  61.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  26.75 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  27.86 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  27.14 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  23.26 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  24.44 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  28.12 
 
 		 525 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  25.63 
 
 		 549 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  21.01 
 
 		 564 aa  60.1  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  21.29 
 
 		 565 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2816  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  24.12 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4146  All-trans-retinol 13,14-reductase  26.33 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.559453  decreased coverage  0.00452261 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  31.36 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>