More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4011 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_4011  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1083 aa  2122    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  33.67 
 
 		 1061 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1560  UvrD/REP helicase  31.88 
 
 		 1054 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.538348  normal  0.490234 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1160  UvrD/REP helicase  31.98 
 
 		 1064 aa  393  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.737588 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05980  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  32.09 
 
 		 1104 aa  314  4.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.061722  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5440  UvrD/REP helicase  28.76 
 
 		 1051 aa  206  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.202358 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  27.38 
 
 		 1080 aa  157  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  25.03 
 
 		 1149 aa  140  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.68 
 
 		 1241 aa  135  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.57 
 
 		 1241 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.46 
 
 		 1241 aa  132  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.46 
 
 		 1241 aa  131  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.46 
 
 		 1241 aa  131  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.46 
 
 		 1241 aa  131  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  23.38 
 
 		 1240 aa  131  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  23.46 
 
 		 1241 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  23.46 
 
 		 1241 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  23.99 
 
 		 1074 aa  130  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  23.29 
 
 		 1242 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  23.54 
 
 		 1241 aa  129  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  26.08 
 
 		 1251 aa  128  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  27.46 
 
 		 1123 aa  128  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1057 aa  125  6e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  25.47 
 
 		 1121 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.31 
 
 		 1186 aa  123  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  24.74 
 
 		 1165 aa  121  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  21.5 
 
 		 1065 aa  115  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  22.03 
 
 		 1121 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1061 aa  111  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  22.6 
 
 		 1230 aa  109  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.62 
 
 		 1203 aa  109  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 741 aa  108  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  26.5 
 
 		 1115 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.33 
 
 		 1168 aa  106  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  29.98 
 
 		 833 aa  107  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  26.71 
 
 		 1117 aa  106  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  27.49 
 
 		 1262 aa  106  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3206  UvrD/REP helicase  25.09 
 
 		 1290 aa  105  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  22.1 
 
 		 1244 aa  105  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  23.57 
 
 		 1089 aa  103  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  24.65 
 
 		 1244 aa  104  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  25.46 
 
 		 1125 aa  104  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  26.51 
 
 		 1120 aa  104  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  28.95 
 
 		 1047 aa  102  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  26.93 
 
 		 1119 aa  100  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  26.19 
 
 		 721 aa  101  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.48 
 
 		 1177 aa  100  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  27.36 
 
 		 1106 aa  99.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1693  Exodeoxyribonuclease V  26.57 
 
 		 1125 aa  99  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  27.01 
 
 		 1242 aa  98.2  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  28.62 
 
 		 1131 aa  97.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  27.53 
 
 		 788 aa  97.8  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.33 
 
 		 787 aa  97.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  27.65 
 
 		 743 aa  97.1  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.73 
 
 		 731 aa  97.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  21.81 
 
 		 656 aa  96.7  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  25.98 
 
 		 721 aa  96.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  24.89 
 
 		 1155 aa  96.3  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  28.57 
 
 		 1156 aa  96.3  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  24.8 
 
 		 722 aa  95.5  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  22.79 
 
 		 1392 aa  94.7  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2512  UvrD/REP helicase  29.93 
 
 		 1192 aa  95.1  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3947  DNA-dependent helicase II  26.67 
 
 		 730 aa  94  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2149  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.39 
 
 		 1203 aa  94  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.277093  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  31.87 
 
 		 1101 aa  94.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  22.8 
 
 		 1218 aa  93.6  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  25.13 
 
 		 724 aa  93.6  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1715  UvrD/REP helicase  25.78 
 
 		 787 aa  92.8  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1166  UvrD/REP helicase  28.02 
 
 		 1152 aa  92.8  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.638752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  21.91 
 
 		 1282 aa  92.8  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  26.18 
 
 		 814 aa  92.4  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  20.71 
 
 		 1130 aa  92  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  25.34 
 
 		 722 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 1240 aa  91.7  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.16 
 
 		 788 aa  92  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  25.73 
 
 		 721 aa  91.7  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.66 
 
 		 786 aa  90.5  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  25.34 
 
 		 1226 aa  90.9  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  25.15 
 
 		 722 aa  91.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0419  UvrD/REP helicase  21.21 
 
 		 1003 aa  90.5  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  25.15 
 
 		 722 aa  91.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  25.15 
 
 		 722 aa  91.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  25.1 
 
 		 734 aa  90.9  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  27.98 
 
 		 1157 aa  90.9  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.13 
 
 		 1200 aa  90.1  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  26.43 
 
 		 726 aa  90.1  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2919  UvrD/REP helicase  23.33 
 
 		 621 aa  90.1  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  27.95 
 
 		 1110 aa  90.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  21.21 
 
 		 783 aa  90.1  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  27.77 
 
 		 829 aa  89.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  22.85 
 
 		 655 aa  89.7  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  21.76 
 
 		 1204 aa  89.4  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  23.21 
 
 		 1217 aa  89.7  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0006  UvrD/REP helicase  22.93 
 
 		 945 aa  89.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.416534  hitchhiker  0.0000067994 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  24.6 
 
 		 724 aa  89.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  22.01 
 
 		 1217 aa  89.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  22.01 
 
 		 1217 aa  89.4  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.62 
 
 		 751 aa  89  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.71 
 
 		 713 aa  88.6  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  24.57 
 
 		 1164 aa  88.6  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>