More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3694 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
638 aa  1155    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 
573 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  28.08 
 
 
573 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.1 
 
 
563 aa  144  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
722 aa  144  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  26.19 
 
 
573 aa  143  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
567 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
594 aa  133  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.32 
 
 
572 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 
568 aa  130  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.99 
 
 
566 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  42.96 
 
 
632 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 
566 aa  124  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  36.02 
 
 
425 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  32.77 
 
 
572 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.23 
 
 
572 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  34.43 
 
 
566 aa  113  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  40.39 
 
 
595 aa  113  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 
642 aa  112  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  34.89 
 
 
566 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  39.2 
 
 
900 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.79 
 
 
557 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  37.62 
 
 
572 aa  109  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 
572 aa  108  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
617 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  38.51 
 
 
599 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 
565 aa  107  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 
878 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  35.22 
 
 
621 aa  106  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  38.73 
 
 
621 aa  107  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  35.22 
 
 
621 aa  106  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 
585 aa  107  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  31.86 
 
 
593 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  35.4 
 
 
593 aa  105  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.55 
 
 
571 aa  104  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
617 aa  104  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  31.28 
 
 
583 aa  104  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.74 
 
 
810 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.7 
 
 
610 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
594 aa  103  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.14 
 
 
594 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
610 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
883 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
592 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  34.14 
 
 
584 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  29.36 
 
 
619 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  32.69 
 
 
562 aa  102  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  34.19 
 
 
677 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3573  putative ribonuclease E  56.43 
 
 
190 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 
573 aa  100  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  38.51 
 
 
581 aa  100  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  31.44 
 
 
592 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
607 aa  99.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 
562 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 
613 aa  99.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.15 
 
 
633 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  34.02 
 
 
603 aa  98.6  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.89 
 
 
633 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  33.11 
 
 
584 aa  98.6  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
631 aa  99  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.02 
 
 
553 aa  98.2  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 
579 aa  98.2  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.34 
 
 
599 aa  97.4  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
599 aa  97.1  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
574 aa  97.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.98 
 
 
619 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  34.18 
 
 
595 aa  94.7  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 
622 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 
584 aa  93.2  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 
571 aa  92.4  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  33.51 
 
 
613 aa  92.8  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 
613 aa  92  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
576 aa  91.7  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 
804 aa  91.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  26.72 
 
 
573 aa  91.3  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  34.46 
 
 
494 aa  90.1  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 
607 aa  90.1  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 
607 aa  89  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  33.16 
 
 
607 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 
607 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  29.97 
 
 
586 aa  88.2  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
607 aa  88.2  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  32.37 
 
 
495 aa  88.2  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 
552 aa  88.2  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  40 
 
 
625 aa  87.8  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
566 aa  87.8  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  29.48 
 
 
590 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  34.67 
 
 
587 aa  87.4  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
934 aa  87  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.83 
 
 
581 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  29.79 
 
 
575 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  37.26 
 
 
620 aa  85.9  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  33.89 
 
 
606 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  33.89 
 
 
606 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  33.89 
 
 
606 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  33.89 
 
 
606 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  33.89 
 
 
606 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  33.89 
 
 
606 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  33.89 
 
 
606 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.25 
 
 
612 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>