More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3556 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  85.36 
 
 
403 aa  684    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  85.86 
 
 
403 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  85.36 
 
 
403 aa  659    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  100 
 
 
403 aa  798    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  54.61 
 
 
413 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  46.38 
 
 
403 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  48.87 
 
 
405 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  48.25 
 
 
403 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  45.77 
 
 
403 aa  363  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  44.78 
 
 
402 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  44.42 
 
 
402 aa  359  4e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  43.78 
 
 
402 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  44.58 
 
 
400 aa  354  1e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  42.75 
 
 
404 aa  353  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  45.75 
 
 
402 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  48.25 
 
 
403 aa  352  7e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  46.29 
 
 
401 aa  350  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  48.75 
 
 
403 aa  349  6e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  43.53 
 
 
403 aa  348  9e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  48.52 
 
 
395 aa  344  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  42.93 
 
 
403 aa  344  2e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  48.13 
 
 
399 aa  343  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  47.78 
 
 
409 aa  341  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  48.62 
 
 
400 aa  341  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  48.38 
 
 
400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  49.25 
 
 
415 aa  338  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  50 
 
 
401 aa  338  8e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  50 
 
 
401 aa  338  8e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  42.25 
 
 
403 aa  338  9e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  48.27 
 
 
412 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  46.97 
 
 
403 aa  334  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  50.25 
 
 
415 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  41.75 
 
 
403 aa  334  2e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  41.5 
 
 
403 aa  332  5e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  48.86 
 
 
402 aa  328  9e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  48.48 
 
 
407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  48.09 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  49.75 
 
 
416 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  48.09 
 
 
399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  47.37 
 
 
404 aa  321  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  40.95 
 
 
401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  47.8 
 
 
406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  47.39 
 
 
421 aa  319  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  44.5 
 
 
403 aa  319  6e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  51.08 
 
 
404 aa  318  9e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  49.87 
 
 
406 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  46.35 
 
 
402 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  47.12 
 
 
402 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  48.48 
 
 
415 aa  316  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  46.76 
 
 
402 aa  315  7e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  46.51 
 
 
408 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  45.75 
 
 
415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  44.28 
 
 
537 aa  311  9e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  45.5 
 
 
403 aa  311  1e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  44 
 
 
402 aa  310  4e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  48.01 
 
 
410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  45.52 
 
 
416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  44.53 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  47.25 
 
 
402 aa  307  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  48.01 
 
 
402 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  44.91 
 
 
403 aa  305  9.000000000000001e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  47.27 
 
 
415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  45.84 
 
 
412 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  44.84 
 
 
402 aa  302  8.000000000000001e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  43.89 
 
 
412 aa  300  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  46.52 
 
 
412 aa  300  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  46 
 
 
402 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  47.38 
 
 
403 aa  298  2e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  46.37 
 
 
402 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  46.8 
 
 
418 aa  296  4e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  42.54 
 
 
398 aa  296  5e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  47.37 
 
 
403 aa  296  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  45.91 
 
 
443 aa  295  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  40.51 
 
 
406 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  46.65 
 
 
411 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  47.61 
 
 
412 aa  293  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  46.77 
 
 
398 aa  292  7e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  45.25 
 
 
410 aa  291  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  43.25 
 
 
411 aa  291  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  47.37 
 
 
403 aa  288  1e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  42.82 
 
 
408 aa  287  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  46.09 
 
 
421 aa  286  5e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  44.06 
 
 
415 aa  286  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  45.5 
 
 
411 aa  285  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  39.9 
 
 
402 aa  285  9e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  41.64 
 
 
408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4294  threonine dehydratase  44.42 
 
 
425 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  41.27 
 
 
410 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  47.47 
 
 
422 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7574  threonine dehydratase  46.4 
 
 
415 aa  276  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31740  predicted protein  44.08 
 
 
468 aa  275  8e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.414163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  45.48 
 
 
404 aa  272  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  41.79 
 
 
414 aa  271  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  44.5 
 
 
401 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  42.75 
 
 
402 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  40.05 
 
 
511 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  43.47 
 
 
404 aa  269  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  41.56 
 
 
520 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  43.43 
 
 
405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6836  threonine dehydratase  44.8 
 
 
413 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>