More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3241 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
221 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3008  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3115  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 
215 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2923  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
215 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117755  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0246  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4366  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00655225  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  33.99 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  33.56 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
324 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0312  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.041978  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 
203 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
191 aa  62  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
335 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
204 aa  58.9  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 
198 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 
72 aa  58.5  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 
203 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
125 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 
188 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
188 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
188 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
188 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
188 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
250 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
280 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 
215 aa  55.1  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
254 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
188 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 
221 aa  55.1  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 
188 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  28.1 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
254 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
254 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 
191 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
206 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
254 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
254 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  36.89 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
254 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
254 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
254 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 
255 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  25.13 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 
190 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  43.82 
 
 
183 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03740  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 
249 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  51.79 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
238 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 
220 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
204 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 
226 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
195 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 
216 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 
190 aa  52.4  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
176 aa  52.4  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 
234 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 
201 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
228 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  40 
 
 
251 aa  52  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
209 aa  52  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
203 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
223 aa  51.6  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 
235 aa  51.6  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 
240 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
204 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 
248 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
238 aa  51.6  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>