227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3076 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
540 aa  1088  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  76.45 
 
 
543 aa  800  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  76.45 
 
 
547 aa  797  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  76.82 
 
 
543 aa  803  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.09 
 
 
556 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  48.71 
 
 
552 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  48.71 
 
 
632 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  48.71 
 
 
653 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  48.71 
 
 
632 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  48.71 
 
 
632 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  48.53 
 
 
696 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  48.71 
 
 
632 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  48.71 
 
 
632 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.72 
 
 
583 aa  462  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.31 
 
 
557 aa  460  1e-128  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.62 
 
 
546 aa  458  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  47.87 
 
 
591 aa  453  1e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  47.87 
 
 
591 aa  453  1e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.38 
 
 
623 aa  453  1e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  47.87 
 
 
591 aa  453  1e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  47.51 
 
 
578 aa  447  1e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  48.56 
 
 
564 aa  440  1e-122  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  47.05 
 
 
657 aa  441  1e-122  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  49.54 
 
 
563 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  47.38 
 
 
622 aa  438  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  47.4 
 
 
578 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  46.41 
 
 
578 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  47.2 
 
 
569 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  48.6 
 
 
577 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  5.17221e-05  hitchhiker  8.05295e-05 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.7 
 
 
537 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  45.25 
 
 
587 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  48.04 
 
 
567 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.17 
 
 
570 aa  408  1e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.5 
 
 
593 aa  405  1e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  47.57 
 
 
562 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  48.39 
 
 
581 aa  401  1e-110  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  45.39 
 
 
577 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  49.72 
 
 
567 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.64 
 
 
582 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  47.59 
 
 
563 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.01 
 
 
586 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  48.43 
 
 
556 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.24 
 
 
565 aa  358  1e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.32 
 
 
562 aa  344  3e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 
889 aa  181  3e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.53 
 
 
572 aa  180  6e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  29.38 
 
 
554 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  31.31 
 
 
533 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.93 
 
 
786 aa  144  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  28.55 
 
 
1150 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  27.54 
 
 
502 aa  124  6e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  1.40216e-05 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  29.53 
 
 
538 aa  122  2e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.88 
 
 
1132 aa  120  5e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.14 
 
 
1152 aa  119  1e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  27.37 
 
 
1152 aa  115  1e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  26.59 
 
 
530 aa  115  2e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.07 
 
 
1150 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  4.90282e-05  unclonable  7.21023e-05 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  33.94 
 
 
513 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  27.24 
 
 
543 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  26.85 
 
 
543 aa  97.4  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  26.47 
 
 
541 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.35 
 
 
552 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  27.64 
 
 
544 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  25.31 
 
 
546 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  27.79 
 
 
543 aa  90.9  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.61 
 
 
535 aa  89.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.18 
 
 
527 aa  80.5  6e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.81 
 
 
532 aa  78.2  4e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  21.07 
 
 
697 aa  76.3  1e-12  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.61 
 
 
562 aa  76.3  1e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.5 
 
 
532 aa  75.5  3e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  25.57 
 
 
534 aa  72.8  1e-11  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  29.39 
 
 
547 aa  72.8  1e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  23.75 
 
 
528 aa  72.4  2e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.31 
 
 
520 aa  71.2  5e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.7 
 
 
556 aa  70.5  7e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.09 
 
 
550 aa  70.1  9e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  28.53 
 
 
551 aa  70.1  9e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  24.16 
 
 
534 aa  68.9  2e-10  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  31.79 
 
 
533 aa  68.2  3e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.11 
 
 
520 aa  68.6  3e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90828  long chain fatty acid oxidase  21.52 
 
 
699 aa  68.2  4e-10  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.654464 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0434  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.5 
 
 
541 aa  67.8  5e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.07 
 
 
515 aa  65.5  3e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  24.49 
 
 
521 aa  63.5  8e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.37 
 
 
526 aa  63.2  1e-08  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.46 
 
 
527 aa  63.2  1e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4222  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.5 
 
 
541 aa  62.4  2e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.689308 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  24.51 
 
 
1146 aa  62.8  2e-08  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.75 
 
 
533 aa  62  3e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  55.38 
 
 
534 aa  61.6  4e-08  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.33 
 
 
505 aa  58.9  2e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.4 
 
 
494 aa  59.3  2e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.65 
 
 
547 aa  59.3  2e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5172  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.06 
 
 
532 aa  57.8  5e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.2 
 
 
563 aa  57.4  7e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  36.99 
 
 
509 aa  57  9e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  43.28 
 
 
563 aa  56.2  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  41.18 
 
 
745 aa  56.6  1e-06  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5122  GMC family oxidoreductase  43.64 
 
 
532 aa  56.6  1e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>