More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2780 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  100 
 
 
316 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  74 
 
 
304 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  74.33 
 
 
304 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  73.33 
 
 
304 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  32.11 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.45 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  32.53 
 
 
336 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  27.18 
 
 
325 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  34.16 
 
 
322 aa  115  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  27.27 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.13 
 
 
337 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.32 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  26.74 
 
 
356 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  26.74 
 
 
356 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  36.04 
 
 
369 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2092  hypothetical protein  33.73 
 
 
261 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  25.74 
 
 
354 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  23.76 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  35 
 
 
293 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  30.51 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.21 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  29.56 
 
 
267 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.56 
 
 
309 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.11 
 
 
293 aa  92.8  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  32.57 
 
 
343 aa  92.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  30.58 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.09 
 
 
349 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  30.31 
 
 
361 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  34.55 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0230  folate-binding protein YgfZ  30.66 
 
 
329 aa  90.5  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.48 
 
 
409 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.43 
 
 
361 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2127  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.89 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  33.33 
 
 
328 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.6 
 
 
293 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.41 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0505  folate-binding protein YgfZ  31.02 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.79 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.59 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.27 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  27.8 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.26 
 
 
385 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.1 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1985  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.84 
 
 
248 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.66 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  31.46 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  28.43 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  28.52 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.71 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  30.53 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.53 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  28.37 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  33.46 
 
 
368 aa  79  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.86 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  31.65 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  30.89 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  30.24 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.61 
 
 
367 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.8 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  30.8 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  30.8 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  29.09 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1830  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.07 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  29.35 
 
 
389 aa  75.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1432  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.48 
 
 
373 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  30.71 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  32.22 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0712  folate-binding protein YgfZ  28.41 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537236 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0047  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.67 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.21464  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.34 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0691  folate-binding protein YgfZ  31.71 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1737  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.59 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00179211  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1041  putative glycine cleavage T protein (aminomethyltransferase)  26.32 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255858  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4360  folate-binding protein YgfZ  31.27 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689561  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2265  putative glycine cleavage T protein (aminomethyltransferase)  28.32 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  29.48 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.96 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2950  hypothetical protein  27.52 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0748  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.48 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1354  glycine cleavage system T protein  24.57 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.91248  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2505  folate-binding protein YgfZ  27.3 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438476  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.2 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.7 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3471  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.52 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  23.62 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  26.97 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.22 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2199  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.81 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.48 
 
 
376 aa  69.3  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  23.96 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  31.3 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0861  hypothetical protein  25.91 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13620  ygfZ-like protein  29.88 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.33 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1830  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.63 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1165  folate-binding protein YgfZ  29.74 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.818193  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.77 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.77 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  21.1 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>