More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2717 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2717  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 90 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  78.48 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  78.48 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  75.95 
 
 		 92 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  51.72 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  50.62 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  51.22 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 89 aa  69.3  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  53.95 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  47.78 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  53.09 
 
 		 89 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  47.5 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  50.62 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 85 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  50.62 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  50.62 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3104  ribosomal protein S20  51.25 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6963  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3922  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1191  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000303326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3035  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.051603  normal  0.325405 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7677  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118438  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4514  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  47.73 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1096  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000700681  normal  0.0325702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4039  30S ribosomal protein S20  45.98 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  46.91 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0001  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.714217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  46.34 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2678  30S ribosomal protein S20  42.05 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.855392  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4890  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.540354  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  44.05 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4421  30S ribosomal protein S20  48.75 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  41.77 
 
 		 88 aa  62  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0531  30S ribosomal protein S20  47.56 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4712  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 87 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  43.42 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5323  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.761405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0600  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0802  ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0707  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4562  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  41.46 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0001  30S ribosomal protein S20  47.5 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0641  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647122  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0646  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>