More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2496 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2496  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
482 aa  976  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.499432  decreased coverage  0.000437171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2590  cysteinyl-tRNA synthetase  72.82 
 
 
481 aa  681  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0727872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2683  cysteinyl-tRNA synthetase  72.61 
 
 
481 aa  678  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1273  cysteinyl-tRNA synthetase  73.24 
 
 
481 aa  690  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
493 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
485 aa  488  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
481 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
487 aa  485  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  48.87 
 
 
481 aa  479  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
494 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 
460 aa  466  1e-130  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 
454 aa  463  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
480 aa  461  1e-128  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
456 aa  461  1e-128  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
485 aa  461  1e-128  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
480 aa  455  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
455 aa  455  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
485 aa  453  1e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
459 aa  452  1e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.79239e-08  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 
459 aa  452  1e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
459 aa  453  1e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  7.06228e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
459 aa  455  1e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.05927e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 
459 aa  454  1e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.84367e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
485 aa  452  1e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
479 aa  454  1e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
459 aa  453  1e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.05095e-06  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
459 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 
461 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.2906e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
459 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
461 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  4.06523e-06  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
493 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 
461 aa  447  1e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.64638e-05  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
461 aa  446  1e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 
461 aa  447  1e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  9.73737e-07  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
459 aa  447  1e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.69576e-05  decreased coverage  4.05781e-07 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
485 aa  447  1e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
465 aa  447  1e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 
460 aa  446  1e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
461 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
490 aa  443  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
461 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  3.07026e-05 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
461 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.39481e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
459 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  2.5745e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
458 aa  443  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
461 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  5.65226e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
461 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6809  cysteinyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
495 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
460 aa  439  1e-122  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
485 aa  441  1e-122  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 
454 aa  441  1e-122  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
459 aa  441  1e-122  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
488 aa  436  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
459 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  47.27 
 
 
459 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
460 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.55216e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
505 aa  438  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
462 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
463 aa  438  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
488 aa  432  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
473 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
459 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.26973e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
500 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  3.51954e-08  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 
483 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
460 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
456 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1735  cysteinyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
460 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27756  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0858  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
473 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
460 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  46.84 
 
 
485 aa  429  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  46.99 
 
 
461 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3638  cysteinyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
460 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1842 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 
464 aa  425  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  48.14 
 
 
497 aa  427  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
463 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1432  cysteinyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
465 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2596  cysteinyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
465 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0629177  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
465 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2159  cysteinyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
465 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2545  cysteinyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
465 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
461 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1656  cysteinyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
465 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000728192  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2681  cysteinyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
465 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3156  cysteinyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
465 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.719949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
461 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
461 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
460 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0537  cysteinyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
485 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
461 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
461 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
460 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
461 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
460 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.30638e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
461 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
461 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
465 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 
460 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
460 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
465 aa  425  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
463 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
461 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.38742e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>