More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2350 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2350  RNA modification protein  100 
 
 		 450 aa  847    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787285  normal  0.113226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.59 
 
 		 429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.71 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.78 
 
 		 434 aa  307  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.1 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.44 
 
 		 432 aa  290  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.71 
 
 		 431 aa  282  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.73 
 
 		 495 aa  276  5e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  31.39 
 
 		 454 aa  273  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.1 
 
 		 444 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.63 
 
 		 456 aa  266  7e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.72 
 
 		 435 aa  265  8e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.82 
 
 		 451 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.37 
 
 		 427 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.27 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  40.47 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  32.23 
 
 		 431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  31.21 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0422  RNA modification protein  34.9 
 
 		 446 aa  253  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0536856  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  39.15 
 
 		 437 aa  251  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.41 
 
 		 449 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.33 
 
 		 442 aa  250  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  31.9 
 
 		 458 aa  249  5e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  30.82 
 
 		 434 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  37.15 
 
 		 435 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  33.41 
 
 		 438 aa  247  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.71 
 
 		 439 aa  244  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.2 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.13 
 
 		 449 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.21 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.33 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.1 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.85 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  31.22 
 
 		 441 aa  237  4e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  36.07 
 
 		 439 aa  236  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  34.12 
 
 		 436 aa  236  8e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.05 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.97 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.91 
 
 		 450 aa  233  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.89 
 
 		 438 aa  233  8.000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  33.57 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  33.57 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  33.18 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  31.68 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  32.24 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  32.24 
 
 		 448 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  33.33 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  32.14 
 
 		 451 aa  230  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  31.84 
 
 		 448 aa  229  6e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  32.88 
 
 		 451 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  32.81 
 
 		 450 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  32.81 
 
 		 450 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 450 aa  229  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  33.1 
 
 		 450 aa  229  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  33.41 
 
 		 449 aa  229  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  33.33 
 
 		 450 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  33.33 
 
 		 450 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1790  RNA modification enzyme, MiaB family  35.98 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0115132  normal  0.0236064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.78 
 
 		 441 aa  226  9e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0352  RNA modification enzyme, MiaB family  35.54 
 
 		 458 aa  225  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.135679  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.28 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.44 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2352  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.25 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.8 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.07 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1749  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.67 
 
 		 451 aa  221  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000349639  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0789  tRNA 2-methylthioadenosine synthase  29.44 
 
 		 411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.594901  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  36.19 
 
 		 436 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1560  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.51 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.25 
 
 		 430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.66 
 
 		 417 aa  216  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0214  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.28 
 
 		 420 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0176423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0689  RNA modification enzyme, MiaB family  39.68 
 
 		 440 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0566  hypothetical protein  34.85 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.59061  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0217  MiaB family tRNA modification protein  30.3 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0459  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.66 
 
 		 453 aa  213  7.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.240377  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2948  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.08 
 
 		 410 aa  212  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  hitchhiker  0.001764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.59 
 
 		 420 aa  211  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0503  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.9 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.39 
 
 		 421 aa  209  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2852  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.82 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2721  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37 
 
 		 410 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2843  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.84 
 
 		 410 aa  207  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07660  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.66 
 
 		 409 aa  207  4e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.738464 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.84 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.63 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.39 
 
 		 416 aa  203  6e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2221  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.48 
 
 		 444 aa  202  9e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_835  tRNA modification enzyme, MiaB family  32.55 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.258618  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0626  RNA modification enzyme, MiaB family  35.98 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.196268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2722  hypothetical protein  37.32 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1849  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.05 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.922054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0184  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.77 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.96 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6072  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.61 
 
 		 449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0928741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1933  hypothetical protein  32.28 
 
 		 427 aa  200  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1860  hypothetical protein  32.28 
 
 		 427 aa  200  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.17951  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5336  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.01 
 
 		 408 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.58 
 
 		 441 aa  199  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>