More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2073 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
168 aa  333  8e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  87.8 
 
 
166 aa  296  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  87.8 
 
 
166 aa  296  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  87.8 
 
 
166 aa  296  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  60 
 
 
158 aa  189  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  62.34 
 
 
158 aa  189  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 
158 aa  189  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 
158 aa  190  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 
158 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 
158 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  63.87 
 
 
158 aa  188  3e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  57.96 
 
 
158 aa  188  3e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  56.49 
 
 
154 aa  187  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 
157 aa  187  6e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 
157 aa  187  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  62.25 
 
 
152 aa  187  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  60.65 
 
 
158 aa  187  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  61.29 
 
 
158 aa  187  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 
158 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 
158 aa  186  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  60 
 
 
173 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  59.35 
 
 
158 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  59.35 
 
 
158 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  60.65 
 
 
168 aa  184  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 
158 aa  184  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  56.6 
 
 
158 aa  184  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  56.6 
 
 
158 aa  184  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 
157 aa  183  8e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  58.97 
 
 
157 aa  183  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  55.97 
 
 
159 aa  182  1e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  56.69 
 
 
174 aa  183  1e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 
203 aa  182  1e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 
158 aa  183  1e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 
158 aa  182  2e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  54.49 
 
 
158 aa  182  2e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  56.69 
 
 
165 aa  182  2e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  59.35 
 
 
179 aa  182  2e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 
158 aa  181  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  56.69 
 
 
158 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  59.35 
 
 
158 aa  181  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  57.32 
 
 
158 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 
159 aa  181  4e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 
157 aa  181  4e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  59.35 
 
 
176 aa  181  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 
157 aa  180  7e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  60.26 
 
 
152 aa  180  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  56.69 
 
 
158 aa  180  8e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  55.13 
 
 
156 aa  180  8e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  55.13 
 
 
156 aa  180  9e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  55.19 
 
 
157 aa  180  9e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  55.13 
 
 
156 aa  180  9e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  56.77 
 
 
158 aa  180  9e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  59.35 
 
 
158 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  58.06 
 
 
158 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 
157 aa  179  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  58.28 
 
 
152 aa  179  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  58.06 
 
 
158 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  58.06 
 
 
158 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  54.49 
 
 
158 aa  179  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  59.62 
 
 
156 aa  180  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  58.06 
 
 
158 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 
158 aa  178  3e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 
158 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 
158 aa  177  5e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  58.06 
 
 
158 aa  177  6e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  58.06 
 
 
158 aa  177  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 
158 aa  177  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2727  GreA/GreB family elongation factor  57.96 
 
 
160 aa  176  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.148274  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  59.48 
 
 
158 aa  177  9e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  56.77 
 
 
171 aa  176  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 
158 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.82345e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  55.77 
 
 
156 aa  176  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 
158 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  57.14 
 
 
158 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 
158 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 
158 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 
158 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 
158 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 
158 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 
158 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  55.48 
 
 
158 aa  176  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 
158 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 
157 aa  175  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 
158 aa  175  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 
160 aa  175  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 
160 aa  175  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 
158 aa  174  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 
158 aa  174  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 
158 aa  174  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 
160 aa  173  1e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  56.77 
 
 
172 aa  172  2e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 
159 aa  172  2e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 
158 aa  172  2e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.87405e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  57.79 
 
 
157 aa  172  2e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  55.48 
 
 
158 aa  172  2e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.33551e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  55.77 
 
 
158 aa  172  3e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 
158 aa  171  3e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  55.35 
 
 
159 aa  171  4e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.08338e-13  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2007  GreA/GreB family elongation factor  57.42 
 
 
180 aa  170  7e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 
158 aa  170  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.209846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>