More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2030 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  61.06 
 
 
919 aa  1033    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  65.68 
 
 
913 aa  1129    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  62.1 
 
 
903 aa  1082    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.71 
 
 
945 aa  915    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  48.95 
 
 
906 aa  845    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  100 
 
 
927 aa  1838    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1897  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  61.41 
 
 
1088 aa  774    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.41 
 
 
920 aa  1034    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.34 
 
 
897 aa  647    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.263667  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  74.13 
 
 
919 aa  1343    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.81 
 
 
917 aa  967    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.07 
 
 
932 aa  902    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.36 
 
 
901 aa  903    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  59.42 
 
 
935 aa  1006    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1803  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 
894 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.27583 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0169  Na+/solute symporter  41.98 
 
 
894 aa  632  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827667  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 
894 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
896 aa  627  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
893 aa  605  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194917  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1429  hypothetical protein  45.73 
 
 
910 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  44.94 
 
 
1079 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2061  Na+/solute symporter  46.82 
 
 
671 aa  572  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.274324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  45.28 
 
 
1100 aa  555  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.9 
 
 
1316 aa  545  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  44.87 
 
 
1087 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.15 
 
 
1172 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  44.49 
 
 
1087 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  43.26 
 
 
1082 aa  531  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  40.13 
 
 
1169 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 
1169 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 
1071 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.565561 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 
1152 aa  501  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.12 
 
 
1169 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.7 
 
 
1169 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
1163 aa  502  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0715  Na+/solute symporter  44.66 
 
 
1039 aa  502  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.723376  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  39.92 
 
 
1083 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.23 
 
 
1169 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.84 
 
 
1170 aa  499  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 
1168 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.79 
 
 
1156 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.42 
 
 
1168 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  44.33 
 
 
1159 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  44.18 
 
 
1159 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
885 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00597808  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  39.44 
 
 
1323 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.57 
 
 
1323 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 
1159 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  41.99 
 
 
1157 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  41.53 
 
 
1169 aa  475  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.79 
 
 
1158 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.55 
 
 
1159 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 
1159 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  41.94 
 
 
1150 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
1168 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.6 
 
 
1158 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 
1171 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
1168 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
1175 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  40.61 
 
 
1168 aa  466  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 
1167 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.54 
 
 
1172 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  41.26 
 
 
1174 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  42.94 
 
 
1161 aa  462  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  41.31 
 
 
1147 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1174 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.2 
 
 
1172 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  41.41 
 
 
1148 aa  442  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.28 
 
 
1177 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  39.42 
 
 
1177 aa  439  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  38.76 
 
 
1179 aa  436  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  31.32 
 
 
950 aa  432  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  40.76 
 
 
1145 aa  429  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 
1146 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  39.09 
 
 
1146 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
1146 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
1146 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
1140 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.31 
 
 
1070 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  37.17 
 
 
1142 aa  416  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 
1146 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 
1145 aa  412  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.35 
 
 
1159 aa  412  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.06 
 
 
1146 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 
1069 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 
1069 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.095908  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 
1146 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
1140 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 
1070 aa  406  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
1140 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0068  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.7 
 
 
1156 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  36.92 
 
 
1141 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0523  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 
1145 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
1138 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 
1166 aa  366  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  38.99 
 
 
1055 aa  364  4e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 
1161 aa  361  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00719  Multidomain protein contains Na+/proline symporter PutP-like domain, sensory histidine kinase and receiver domain  33.69 
 
 
1147 aa  350  8e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 
1185 aa  347  4e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.58 
 
 
1184 aa  342  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>