More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1974 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1974  pseudouridine synthase  100 
 
 
238 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1865  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  71.11 
 
 
241 aa  291  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1995  pseudouridine synthase  71.11 
 
 
241 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2080  pseudouridine synthase  70.22 
 
 
241 aa  287  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0069  pseudouridine synthase  43.97 
 
 
235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1202  pseudouridine synthase  35.66 
 
 
247 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.90311  normal  0.0231079 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.98 
 
 
313 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0212  RluA family pseudouridine synthase  49.34 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.935896  normal  0.204158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  38.43 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  37.19 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3086  pseudouridine synthase, RluA family  38.96 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2253  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.33 
 
 
391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  37.87 
 
 
302 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  37.97 
 
 
304 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1731  RluA family pseudouridine synthase  38.75 
 
 
405 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3343  pseudouridine synthase, RluA family  38.55 
 
 
341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0105982 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1704  RluA family pseudouridine synthase  38.75 
 
 
407 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  41.03 
 
 
299 aa  125  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  37.45 
 
 
302 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1248  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  37.45 
 
 
302 aa  125  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000362529  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.95 
 
 
334 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.95 
 
 
347 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  37.45 
 
 
302 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169242  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  37.55 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000866742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  37.45 
 
 
302 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3937  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.45 
 
 
302 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000762664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3906  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  37.45 
 
 
302 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000340417 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3743  RNA pseudouridylate synthase  37.45 
 
 
302 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00315275  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6286  pseudouridine synthase, RluD  38.75 
 
 
402 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1793  RluA family pseudouridine synthase  38.75 
 
 
402 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3634  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.45 
 
 
302 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0043574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5094  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.75 
 
 
402 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2613  RluA family pseudouridine synthase  38.31 
 
 
343 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  38.84 
 
 
325 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  37.5 
 
 
400 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0218  pseudouridine synthase, RluA family  47.58 
 
 
301 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0288  RluA family pseudouridine synthase  34.54 
 
 
336 aa  124  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5641  RluA family pseudouridine synthase  39.2 
 
 
334 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0784245  normal  0.0662389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  39.06 
 
 
310 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0061  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.66 
 
 
321 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102185  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2721  pseudouridine synthase  39.82 
 
 
246 aa  122  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0403839  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.66 
 
 
318 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  37.02 
 
 
302 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00039208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1817  RluA family pseudouridine synthase  38.33 
 
 
360 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0207  pseudouridine synthase, RluA family  47.14 
 
 
302 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1742  pseudouridine synthase, RluD  38.2 
 
 
376 aa  122  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0441246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1958  RluA family pseudouridine synthase  42.21 
 
 
293 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.576308  normal  0.790812 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1324  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.49 
 
 
395 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2333  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.49 
 
 
395 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0083  RluA family pseudouridine synthase  38.49 
 
 
389 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1084  RluA family pseudouridine synthase  38.49 
 
 
389 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.346306  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1813  RluA family pseudouridine synthase  38.49 
 
 
389 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2205  RluA family pseudouridine synthase  38.49 
 
 
395 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2168  RluA family pseudouridine synthase  38.49 
 
 
389 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3196  RluA family pseudouridine synthase  38.59 
 
 
315 aa  121  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5183  pseudouridine synthase  38.82 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.521194  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1237  RluA family pseudouridine synthase  35.74 
 
 
334 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289539  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60210  pseudouridine synthase  38.82 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135219 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1721  pseudouridine synthase, RluD  37.4 
 
 
346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0967  RluA family pseudouridine synthase  37.08 
 
 
436 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3146  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.31 
 
 
343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19664  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.32 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2235  RluA family pseudouridine synthase  41.98 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.894524  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1841  pseudouridine synthase, RluA family  38.56 
 
 
431 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.168334 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0553  pseudouridine synthase, RluA family  33.33 
 
 
352 aa  120  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3699  pseudouridine synthase, RluA family  34.01 
 
 
345 aa  119  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3159  pseudouridine synthase, RluA family  40.59 
 
 
329 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.87 
 
 
318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0359  pseudouridine synthase RluD  38.67 
 
 
426 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000104546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2346  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.14 
 
 
438 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0455755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.33 
 
 
325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  40.42 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0771  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.82 
 
 
323 aa  119  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.497941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2950  RluA family pseudouridine synthase  37.45 
 
 
323 aa  118  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118178  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.45 
 
 
334 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0906  pseudouridine synthase, RluA family  37.29 
 
 
344 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447686  normal  0.0333397 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.76 
 
 
296 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  35.74 
 
 
300 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  35.32 
 
 
313 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0971  pseudouridine synthase, RluA family  37.29 
 
 
344 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.158596 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.32 
 
 
296 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2215  RluA family pseudouridine synthase  39.23 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1194  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.82 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2439  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  38.33 
 
 
338 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122309  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3201  RluA family pseudouridine synthase  37.82 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.887852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2132  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.06 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.864009 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2605  pseudouridylate synthase  38.91 
 
 
324 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000283334  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0947  pseudouridine synthase, RluA family  38.21 
 
 
345 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.48756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1621  pseudouridine synthase, RluA family  36.76 
 
 
355 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0454  pseudouridine synthase RluD  37.89 
 
 
324 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.256268 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  38.24 
 
 
319 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0372  pseudouridine synthase, RluA family  38.34 
 
 
334 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5281  RluA family pseudouridine synthase  37.61 
 
 
362 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0773013  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1041  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C protein  37.87 
 
 
331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.017285  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15960  predicted protein  36.68 
 
 
325 aa  115  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.713821  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1324  pseudouridine synthase, RluA family  34.6 
 
 
328 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3499  lysozyme  37.2 
 
 
323 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  normal  0.0395097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.61 
 
 
303 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3046  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.66 
 
 
332 aa  115  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0667  pseudouridine synthase, RluA family protein  37.85 
 
 
324 aa  115  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0233551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>