More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1886 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1886  integration host factor, alpha subunit  100 
 
 		 99 aa  197  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1909  integration host factor subunit alpha  98.89 
 
 		 113 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1969  integration host factor subunit alpha  98.89 
 
 		 113 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0019696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1994  integration host factor subunit alpha  98.89 
 
 		 113 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3742  integration host factor, alpha subunit  87.91 
 
 		 100 aa  160  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  0.554438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2622  histone family protein DNA-binding protein  75.56 
 
 		 92 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1996  histone family protein DNA-binding protein  74.44 
 
 		 92 aa  142  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2224  histone family protein DNA-binding protein  74.44 
 
 		 92 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000923552 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1521  integration host factor, alpha subunit  73.33 
 
 		 91 aa  141  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.43426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1424  integration host factor, alpha subunit  69.89 
 
 		 93 aa  141  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000184784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1417  histone-like DNA-binding protein  75.56 
 
 		 91 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000053245  normal  0.466182 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2302  histone family protein DNA-binding protein  68.82 
 
 		 97 aa  140  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1888  histone family protein DNA-binding protein  67.78 
 
 		 93 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000630839  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0092  integration host factor, alpha subunit  63.33 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1872  histone family protein DNA-binding protein  65.56 
 
 		 94 aa  120  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0238  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 91 aa  120  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2837  integration host factor, alpha subunit  60 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1308  integration host factor, alpha subunit  60 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0180  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2120  integration host factor, alpha subunit  60 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3754  histone family protein DNA-binding protein  60 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159868  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1456  integration host factor, alpha subunit  60.47 
 
 		 99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.405955  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1583  integration host factor subunit alpha  60.47 
 
 		 101 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1731  integration host factor subunit alpha  61.63 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.074622  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2066  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151573  normal  0.0307136 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4386  integration host factor subunit alpha  54.44 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2055  integration host factor subunit alpha  60.47 
 
 		 100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549761  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1146  integration host factor subunit alpha  60.47 
 
 		 99 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0580836  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2510  integration host factor subunit alpha  58.14 
 
 		 100 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2356  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28720  integration host factor subunit alpha  58.14 
 
 		 100 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000206678  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3057  histone-like DNA-binding protein  54.26 
 
 		 97 aa  110  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.581982 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02112  integration host factor subunit alpha  56.98 
 
 		 98 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003703  integration host factor alpha subunit  56.98 
 
 		 98 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281505  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2471  integration host factor subunit alpha  56.98 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2608  integration host factor, alpha subunit  54.84 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2994  integration host factor, alpha subunit  57.47 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2384  integration host factor, alpha subunit  56.98 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1973  integration host factor subunit alpha  56.98 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0364622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2168  integration host factor subunit alpha  56.98 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3475  integration host factor subunit alpha  56.98 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981005  hitchhiker  0.00278356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1937  integration host factor subunit alpha  56.98 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0682795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3219  integration host factor subunit alpha  56.98 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2237  integration host factor, alpha subunit  54.84 
 
 		 99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0376768 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1982  integration host factor subunit alpha  56.98 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219997  normal  0.264768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01681  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00950044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1930  integration host factor, alpha subunit  55.17 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000106762  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1718  integration host factor subunit alpha  54.02 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000312537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1478  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01670  hypothetical protein  55.17 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00452626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1919  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.445655 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1957  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.126843  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0433  integration host factor subunit alpha  58.62 
 
 		 101 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0918  integration host factor, alpha subunit  56.98 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1826  integration host factor subunit alpha  54.02 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2047  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 99 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2619  integration host factor subunit alpha  54.02 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2430  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.446554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1894  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.585308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2150  integration host factor subunit alpha  54.02 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.872084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0268  integration host factor, alpha subunit  53.33 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1931  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000683366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1918  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 92 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1954  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 99 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.57207  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1467  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 99 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2006  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 99 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.608113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1450  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 99 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1792  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 99 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704445  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1434  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 99 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1730  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 99 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.976876  normal  0.494462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1834  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 99 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.155105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0762  integration host factor subunit alpha  58.62 
 
 		 101 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.306695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2186  integration host factor subunit alpha  54.02 
 
 		 98 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.874244  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1013  integration host factor subunit alpha  58.62 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00925023 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02444  integration host factor subunit alpha  52.63 
 
 		 99 aa  107  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0239469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3021  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3019  integration host factor subunit alpha  52.53 
 
 		 101 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.616425  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2677  integration host factor subunit alpha  47.42 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00137939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1805  integration host factor, alpha subunit  56.98 
 
 		 102 aa  107  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2493  integration host factor subunit alpha  54.02 
 
 		 98 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044668  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1522  integration host factor, alpha subunit  52.33 
 
 		 101 aa  106  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00263552  normal  0.735039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4630  integration host factor subunit alpha  51.11 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00633863  normal  0.0311538 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1661  integration host factor, alpha subunit  52.22 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1604  integration host factor subunit alpha  56.98 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316087  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1147  integration host factor subunit alpha  51.02 
 
 		 111 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.205645  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0846  integration host factor subunit alpha  54.65 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000670658  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1668  integration host factor, alpha subunit  54.44 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2651  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.030982  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2687  integration host factor subunit alpha  50 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.48286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1166  integration host factor subunit alpha  54.65 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.516424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2924  integration host factor, alpha subunit  53.33 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242436  hitchhiker  0.000500218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1710  integration host factor subunit alpha  56.32 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.707381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2799  integration host factor subunit alpha  55.81 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2214  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 98 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.600475  normal  0.239128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2468  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 98 aa  104  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0406236  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2596  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 98 aa  104  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2068  integration host factor subunit alpha  55.17 
 
 		 97 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0298794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1951  integration host factor subunit alpha  52.69 
 
 		 98 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0689999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1863  integration host factor subunit alpha  51.72 
 
 		 102 aa  103  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00832208  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1641  integration host factor subunit alpha  54.65 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.860546  normal  0.370826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>