More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1854 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  100 
 
 
1111 aa  2176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.86 
 
 
1131 aa  681  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4308  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.43 
 
 
552 aa  258  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.8 
 
 
318 aa  244  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.65539e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.39 
 
 
443 aa  239  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.06 
 
 
443 aa  237  1e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.75 
 
 
310 aa  232  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  32.82 
 
 
1629 aa  224  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 
933 aa  220  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  3.59369e-05 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 
687 aa  219  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
1207 aa  219  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 
944 aa  214  6e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1275  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.53 
 
 
304 aa  214  8e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00827298  normal  0.435617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
1064 aa  210  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
799 aa  206  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0087  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.08 
 
 
308 aa  203  1e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.010948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.03 
 
 
441 aa  203  2e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.130175  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
1352 aa  199  2e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
1141 aa  195  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.99 
 
 
313 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 
823 aa  193  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
1145 aa  192  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
620 aa  190  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 
965 aa  190  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.04 
 
 
326 aa  189  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
829 aa  189  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  23.22 
 
 
1046 aa  188  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 
1363 aa  187  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 
1166 aa  187  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  36.72 
 
 
326 aa  187  1e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3468  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.64 
 
 
412 aa  186  2e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
503 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 
1002 aa  184  9e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 
755 aa  182  3e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  29.52 
 
 
923 aa  181  5e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 
1245 aa  181  6e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  27.39 
 
 
1322 aa  181  6e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.91 
 
 
312 aa  181  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.520966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.81 
 
 
1267 aa  180  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 
1788 aa  177  1e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.18 
 
 
1195 aa  176  2e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3193  diguanylate cyclase  49.16 
 
 
462 aa  176  2e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  31.52 
 
 
556 aa  176  3e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1937  GGDEF domain/HAMP domain-containing protein  47.8 
 
 
436 aa  174  7e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0978  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.6 
 
 
322 aa  174  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.97362  decreased coverage  0.00116316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
991 aa  174  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 
796 aa  174  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 
1782 aa  173  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
640 aa  173  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.24 
 
 
1109 aa  172  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
511 aa  172  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
639 aa  172  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.32 
 
 
887 aa  172  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.11 
 
 
1271 aa  172  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1584  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.98 
 
 
319 aa  171  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.335279  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0768  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.85 
 
 
353 aa  171  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 
1137 aa  171  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.55 
 
 
1193 aa  171  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  29.54 
 
 
925 aa  170  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
722 aa  170  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  1.04285e-09 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 
1255 aa  170  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
1038 aa  170  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
641 aa  170  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.76 
 
 
1768 aa  170  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
953 aa  169  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 
1143 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
639 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1989  diguanylate cyclase  46.15 
 
 
442 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.57818e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  28.44 
 
 
1137 aa  169  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  32.33 
 
 
810 aa  169  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0334  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
492 aa  169  3e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.091816  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.73 
 
 
858 aa  169  3e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
1026 aa  168  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
509 aa  168  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  29.01 
 
 
925 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  28.52 
 
 
1170 aa  168  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
634 aa  168  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 
981 aa  168  6e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2819  diguanylate cyclase  47.25 
 
 
438 aa  168  6e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.20374e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
639 aa  168  7e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 
977 aa  167  7e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  29.75 
 
 
792 aa  168  7e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 
1548 aa  167  7e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 
803 aa  167  7e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
958 aa  167  7e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 
1398 aa  167  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
600 aa  167  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 
818 aa  167  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 
964 aa  167  1e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.78 
 
 
1765 aa  167  1e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.78 
 
 
340 aa  167  1e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.483  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 
916 aa  167  1e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 
711 aa  166  2e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
612 aa  166  2e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
974 aa  166  2e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
377 aa  166  2e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  26.13 
 
 
1200 aa  166  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.81 
 
 
919 aa  166  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
885 aa  166  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
1060 aa  166  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>