61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1618 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1618  ABC-2 type transporter  100 
 
 
269 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3359  ABC-2 type transporter  71.8 
 
 
270 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3168  ABC transporter, inner membrane subunit  71.43 
 
 
270 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3285  ABC-2 type transporter  71.8 
 
 
270 aa  358  5e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2239  hypothetical protein  35.8 
 
 
268 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.627796  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0357  hypothetical protein  39.17 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0128  hypothetical protein  36.26 
 
 
276 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.474534  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  37.83 
 
 
276 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0127  ABC-2 transporter component  36.72 
 
 
282 aa  148  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0577  ABC-2 type transporter  35.97 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7657  putative ABC transporter, permease protein  38.81 
 
 
270 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0434  ABC-2 type transporter  36.49 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2789  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 
267 aa  89.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1137  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.18489  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  29.47 
 
 
273 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
261 aa  59.7  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 
262 aa  56.2  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 
270 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  36.49 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 
286 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 
281 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 
279 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.35 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  32.03 
 
 
275 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2611  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 
271 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3305  ABC transporter  28.92 
 
 
258 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1975  putative transmembrane permease ABC transporter protein  32.52 
 
 
274 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0858668  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.37 
 
 
384 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.95 
 
 
253 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  32.03 
 
 
275 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  28.41 
 
 
936 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  28.41 
 
 
936 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1491  ABC transporter  29.51 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1511  ABC transporter  29.51 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0121444  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  30.43 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2486  ABC transporter, permease NodJ  29.73 
 
 
278 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0681495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0689  ABC-2 type transporter, NodJ family  26.97 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0447972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  28.21 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  29.71 
 
 
285 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  29.46 
 
 
243 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  44.19 
 
 
261 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  26.24 
 
 
252 aa  42.7  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.33 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  29.81 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.59 
 
 
253 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.35 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 
270 aa  42.7  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 
270 aa  42.7  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0800  ABC transporter, permease NodJ  30.41 
 
 
278 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.481965  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1853  nodulation ABC transporter NodJ  30.41 
 
 
278 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1839  nodulation ABC transporter NodJ  30.41 
 
 
278 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0361  ABC transporter, permease NodJ  30.41 
 
 
278 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1704  ABC transporter, permease NodJ  30.41 
 
 
278 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2007  ABC transporter, permease NodJ  30.41 
 
 
278 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1219  ABC transporter, permease NodJ  30.41 
 
 
278 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.65632  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.33 
 
 
256 aa  42.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 
281 aa  42  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1657  ABC-2 type transporter  24.63 
 
 
258 aa  42  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0203159  decreased coverage  0.000243184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>